More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1782 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  85.31 
 
 
454 aa  764    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  100 
 
 
430 aa  885    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  83.18 
 
 
437 aa  756    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  82.83 
 
 
437 aa  732    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  85.85 
 
 
434 aa  766    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  81.59 
 
 
432 aa  728    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  84.96 
 
 
441 aa  745    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  81.59 
 
 
432 aa  728    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  61.56 
 
 
412 aa  519  1e-146  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  63.52 
 
 
408 aa  521  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  57.39 
 
 
414 aa  478  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  62.56 
 
 
411 aa  475  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  56.82 
 
 
425 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  56.4 
 
 
419 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  56.68 
 
 
425 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  56.61 
 
 
424 aa  435  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  54.3 
 
 
429 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  54.07 
 
 
428 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  54.68 
 
 
416 aa  431  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  55.86 
 
 
413 aa  428  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  52.76 
 
 
421 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  55.39 
 
 
418 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  55.19 
 
 
426 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  53.46 
 
 
418 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  54.81 
 
 
428 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  52.77 
 
 
439 aa  418  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  53.87 
 
 
424 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  53.33 
 
 
416 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  52.94 
 
 
429 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  54.81 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  54.09 
 
 
428 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  45.43 
 
 
404 aa  354  1e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  40.15 
 
 
404 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  39.66 
 
 
404 aa  297  3e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  40 
 
 
404 aa  293  3e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  38.77 
 
 
403 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  38.44 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  39.47 
 
 
414 aa  272  8.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  38.46 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  36.71 
 
 
421 aa  267  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  39.13 
 
 
419 aa  256  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  38.46 
 
 
401 aa  256  5e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  37.72 
 
 
401 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  37.04 
 
 
402 aa  243  7e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  36.75 
 
 
399 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  37.06 
 
 
401 aa  237  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  35.25 
 
 
416 aa  231  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  38.26 
 
 
402 aa  228  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  35.19 
 
 
441 aa  222  8e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  34.48 
 
 
405 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  32.65 
 
 
403 aa  206  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  39.26 
 
 
346 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  38.33 
 
 
345 aa  203  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  30.95 
 
 
403 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  38.77 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  33.73 
 
 
427 aa  199  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  32.98 
 
 
402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  35.86 
 
 
422 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  34.83 
 
 
351 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  34.08 
 
 
419 aa  194  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  33.49 
 
 
423 aa  192  8e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  37.1 
 
 
348 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  32.74 
 
 
432 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  34.43 
 
 
459 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  34.66 
 
 
354 aa  190  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4007  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.89 
 
 
311 aa  189  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  35.8 
 
 
348 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  33 
 
 
408 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  33.18 
 
 
433 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  36 
 
 
366 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  34.66 
 
 
357 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  35.51 
 
 
348 aa  187  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  37.16 
 
 
368 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  38.04 
 
 
355 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  38.15 
 
 
361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  36.16 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  36.29 
 
 
351 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  36.54 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  31.2 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0596  threonine synthase  34.31 
 
 
380 aa  183  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1282  threonine synthase  38.07 
 
 
353 aa  180  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  33.67 
 
 
397 aa  180  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  36.92 
 
 
368 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  34.94 
 
 
349 aa  179  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  36.81 
 
 
352 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  34.48 
 
 
371 aa  179  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  30.05 
 
 
422 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  36.34 
 
 
377 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  31.52 
 
 
391 aa  178  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  37.61 
 
 
352 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  32.02 
 
 
394 aa  179  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  36.89 
 
 
368 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  36.71 
 
 
352 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  37 
 
 
352 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  36.18 
 
 
363 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  36.42 
 
 
351 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  36.12 
 
 
348 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  37 
 
 
352 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  34.65 
 
 
346 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1253  threonine synthase  37.65 
 
 
363 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.310608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>