More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1772 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1772  30S ribosomal protein S16  100 
 
 
82 aa  165  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1956  30S ribosomal protein S16  82.93 
 
 
82 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1983  30S ribosomal protein S16  82.93 
 
 
82 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5264  30S ribosomal protein S16  82.93 
 
 
82 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.121257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2536  SSU ribosomal protein S16P  80.77 
 
 
141 aa  135  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000571366  decreased coverage  0.00236598 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1143  30S ribosomal protein S16  79.27 
 
 
86 aa  136  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0121256  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4357  30S ribosomal protein S16  78.05 
 
 
86 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000000929169  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13321  30S ribosomal protein S16  72.15 
 
 
125 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.257146  normal  0.676995 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2772  30S ribosomal protein S16  71.95 
 
 
82 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.48934 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19551  30S ribosomal protein S16  72.15 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.669471 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0852  30S ribosomal protein S16  70.89 
 
 
110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14841  30S ribosomal protein S16  70.89 
 
 
121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.321531  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17051  30S ribosomal protein S16  70.89 
 
 
110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.701921  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14461  30S ribosomal protein S16  70.89 
 
 
114 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14701  30S ribosomal protein S16  70.89 
 
 
121 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0883  30S ribosomal protein S16  70.89 
 
 
135 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738027  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1516  30S ribosomal protein S16  70.89 
 
 
130 aa  117  7e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1381  30S ribosomal protein S16  69.62 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  55.41 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
79 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  52 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf245  ribosomal protein S16  46.75 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00213273  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1803  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 
79 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.013631  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1099  30S ribosomal protein S16  45.95 
 
 
79 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1092  ribosomal protein S16  46.43 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000161695  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  49.33 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  43.21 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  45.24 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1447  ribosomal protein S16  46.43 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  43.21 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  46.99 
 
 
92 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  52.78 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  51.39 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1863  ribosomal protein S16  45.88 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000617647  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  41.46 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  42.68 
 
 
95 aa  72  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  43.9 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  47.22 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  43.04 
 
 
81 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  40.24 
 
 
88 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  44.16 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  44.44 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  44.87 
 
 
82 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  43.59 
 
 
81 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  42.5 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  43.21 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  41.77 
 
 
87 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  40.74 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  41.77 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  41.98 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  40.74 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  43.75 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2278  ribosomal protein S16  39.51 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00221023  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0665  30S ribosomal protein S16  36.59 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.0000270999  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  39.24 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  39.76 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  39.51 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  39.51 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  39.51 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  39.51 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  39.51 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  39.51 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  40.24 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  40.24 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  36.14 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  39.51 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  39.51 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  39.51 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  39.51 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  43.59 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  43.59 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  40.24 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  41.46 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0979  30S ribosomal protein S16  38.55 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.924715  normal  0.291876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  40.24 
 
 
95 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  38.55 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  37.97 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  40 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  37.35 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  39.51 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  40.26 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  39.76 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1827  ribosomal protein S16  37.35 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1153  30S ribosomal protein S16  42.31 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  42.67 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  38.46 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  38.46 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  39.51 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00310  SSU ribosomal protein S16P  39.47 
 
 
80 aa  62.4  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000491979  decreased coverage  0.00000000000378635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  38.55 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1483  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 
82 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0143282  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  43.66 
 
 
204 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  37.35 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3594  30S ribosomal protein S16  37.04 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  38.75 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1148  30S ribosomal protein S16  36.59 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0271255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>