80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1762 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1762  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  942    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0355  PUCC protein  53.97 
 
 		 488 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1707  PUCC protein  51.2 
 
 		 487 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1689  PUCC protein  51.2 
 
 		 487 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0459  PUCC protein  49.79 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.222585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0658  PUCC protein  50.94 
 
 		 472 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.573961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3332  PUCC protein  48.14 
 
 		 481 aa  442  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0028  PUCC protein  48.95 
 
 		 477 aa  434  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.30591  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03411  Na+/melibiose symporter  39.78 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1652  light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC-like  36.91 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1903  PUCC protein  31.21 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3432  PUCC protein  29.84 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654139 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0990  PUCC protein  31.56 
 
 		 452 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0707  hypothetical protein  35.85 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1912  PUCC protein  31.03 
 
 		 457 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.199112  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1534  PUCC protein  30.24 
 
 		 457 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00123663  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0518  PUCC protein  32.24 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1543  PUCC protein  31.43 
 
 		 433 aa  169  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848404 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1461  PucC protein  30.08 
 
 		 449 aa  167  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1022  PUCC protein  28.73 
 
 		 434 aa  167  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1287  PUCC protein  29.4 
 
 		 432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2893  PUCC protein  30.13 
 
 		 474 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00562586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0689  PucC protein  29.21 
 
 		 448 aa  160  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.85813  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  27.99 
 
 		 450 aa  160  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3165  PUCC protein  32.93 
 
 		 474 aa  160  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0911  PUCC protein  28.69 
 
 		 449 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.592939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1668  PUCC protein  27.12 
 
 		 448 aa  153  8e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3131  PUCC protein  28.81 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1849  PUCC protein  28.63 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2807  PUCC protein  29.39 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0618  PUCC protein  27.66 
 
 		 480 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3746  PUCC protein  31.45 
 
 		 447 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047851 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2898  pucC  29.02 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3991  light harvesting pigment MFS transporter Bch2  30.64 
 
 		 447 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  normal  0.25213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6412  photosynthetic complex (LH1) assembly protein LhaA  29.36 
 
 		 477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5356  PUCC protein  30.03 
 
 		 481 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3083  chlorophyll major facilitator superfamily (MFS) exporter PucC  27.65 
 
 		 475 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1720  PUCC protein  31 
 
 		 438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1632  PUCC protein  28.85 
 
 		 475 aa  116  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369944  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1933  PUCC protein  31.43 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0290  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  31.43 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3529  PUCC protein  30.52 
 
 		 433 aa  113  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.513682 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4031  PucC protein, chlorophyll MFS exporter  30.24 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.344544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4811  PUCC protein  28.98 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4446  PucC chlorophyll MFS exporter  30 
 
 		 473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1005  PUCC protein  29.21 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0628  PUCC protein  28.91 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3539  PUCC protein  28.95 
 
 		 481 aa  110  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1843  PUCC protein  27.53 
 
 		 475 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.085296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3787  PUCC protein  28.61 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2398  PUCC protein  27.41 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.6432  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3785  PUCC protein  27.41 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1318  PUCC protein  28.57 
 
 		 477 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  0.172961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4821  PUCC protein  30.48 
 
 		 459 aa  107  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2037  PUCC protein  30.02 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0278  putative light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC  32.72 
 
 		 427 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1921  PUCC protein  32.72 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.824161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5366  PUCC protein  30.72 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238327  normal  0.20788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1303  PUCC protein  28.96 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0979  PUCC protein  26.58 
 
 		 459 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5288  PUCC protein  30.32 
 
 		 458 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1680  PUCC protein  27.98 
 
 		 478 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5278  PUCC protein  29.19 
 
 		 481 aa  103  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6423  light harvesting pigment major facilitator family (MFS) transporter, Bch2-like protein  28.98 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1240  PUCC protein  28.32 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000359132  unclonable  0.0000000283623 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1583  PUCC protein  28.25 
 
 		 465 aa  101  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0156  PUCC protein  30.17 
 
 		 478 aa  100  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1017  PUCC protein  30.5 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1735  PUCC protein  29.62 
 
 		 477 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1960  PUCC protein  26.29 
 
 		 459 aa  97.4  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.77527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0315  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  26.29 
 
 		 459 aa  97.4  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3976  LhaA protein  32.34 
 
 		 477 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3731  PUCC protein  31.46 
 
 		 477 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.532821  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3723  PUCC protein  28.42 
 
 		 476 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0690908 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0166  PUCC protein  27.85 
 
 		 417 aa  89.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2062  PUCC protein  28.54 
 
 		 455 aa  87.8  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.035842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3713  PUCC protein  28.96 
 
 		 448 aa  87  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368833  hitchhiker  0.000507532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1853  PUCC protein  27.96 
 
 		 512 aa  87  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1601  PUCC protein  29.01 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>