More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1739 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  279  9e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  57.97 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  54.01 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  54.01 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  42.75 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  38.76 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 136 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  33.86 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  32.28 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  32.28 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  33.86 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.04 
 
 		 135 aa  94.4  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  38.39 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  32.33 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  31.16 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  42.99 
 
 		 135 aa  91.7  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00354  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  30.77 
 
 		 136 aa  90.9  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.784451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.83 
 
 		 132 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  32.31 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  33.83 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 136 aa  88.6  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  30.6 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 134 aa  88.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  31.34 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 157 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 169 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  30.83 
 
 		 155 aa  87.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  34.82 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  36.61 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  87  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  30.08 
 
 		 152 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 152 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  34.48 
 
 		 140 aa  87  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  47.47 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.09 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  29.1 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3212  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356219  normal  0.122177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  32.84 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.54 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  30.37 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 175 aa  84.7  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  36.27 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2318  MerR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  30.77 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 134 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  30.37 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  33.08 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  28.99 
 
 		 159 aa  84.3  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  30.37 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  35.78 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>