More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1722 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1722  thiosulphate-binding protein  100 
 
 
361 aa  726    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4715  thiosulphate-binding protein  60 
 
 
378 aa  408  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.250615  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3492  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.07 
 
 
377 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4714  thiosulphate-binding protein  54.78 
 
 
381 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.217544  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1681  thiosulphate-binding protein  55.46 
 
 
350 aa  375  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235432  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2750  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.52 
 
 
338 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3352  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.01 
 
 
348 aa  362  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.59657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3629  sulfate ABC transporter periplasmic sulfate-binding protein  49.73 
 
 
363 aa  358  9e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2764  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.81 
 
 
361 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8377  normal  0.37323 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3454  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.52 
 
 
346 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0044  thiosulphate-binding protein  53.62 
 
 
385 aa  340  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.17 
 
 
339 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.17 
 
 
339 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  47.9 
 
 
336 aa  296  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.38 
 
 
337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1686  thiosulphate-binding protein  46.2 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.863569  normal  0.139145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  47.73 
 
 
337 aa  281  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4410  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.89 
 
 
342 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.22 
 
 
359 aa  279  6e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3315  hypothetical protein  46.69 
 
 
328 aa  278  8e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227914  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4392  sulfate transporter subunit  47.08 
 
 
329 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.694674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4309  sulfate transporter subunit  47.08 
 
 
329 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  47.57 
 
 
331 aa  276  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4461  sulfate transporter subunit  46.75 
 
 
329 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4394  sulfate transporter subunit  46.75 
 
 
329 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3094  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.98 
 
 
336 aa  275  8e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.42 
 
 
329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  45.78 
 
 
329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.78 
 
 
329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  46.43 
 
 
329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.04 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  45.78 
 
 
329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  45.78 
 
 
329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  46.13 
 
 
330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  45.78 
 
 
329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  45.78 
 
 
329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  45.78 
 
 
329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.04 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4055  sulfate transporter subunit  45.78 
 
 
329 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  45.45 
 
 
329 aa  273  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  46.86 
 
 
329 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1183  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.83 
 
 
336 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  45.45 
 
 
329 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1552  thiosulphate-binding protein  44.76 
 
 
335 aa  270  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.06 
 
 
356 aa  270  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0563  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.98 
 
 
341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201199  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  45.6 
 
 
329 aa  269  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2196  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.59 
 
 
345 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.559252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03700  sulfate-binding protein precursor  44.95 
 
 
332 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.69 
 
 
337 aa  269  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.52 
 
 
337 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2422  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.14 
 
 
343 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  46.15 
 
 
346 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.26 
 
 
341 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0374  sulfate-binding protein precursor  44.66 
 
 
332 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0967  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.06 
 
 
337 aa  265  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4345  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.41 
 
 
332 aa  265  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1045  thiosulphate-binding protein  44.44 
 
 
327 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2345  thiosulphate-binding protein  46.08 
 
 
342 aa  265  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6842  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0628  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.03 
 
 
335 aa  264  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  45.48 
 
 
807 aa  262  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0821  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.28 
 
 
329 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0561556  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0614  thiosulphate-binding protein  43.87 
 
 
329 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.772188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0123  thiosulfate binding protein  44.04 
 
 
337 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000442607 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1781  thiosulphate-binding protein  45.54 
 
 
344 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1394  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.88 
 
 
338 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2246  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.69 
 
 
349 aa  259  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1044  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.41 
 
 
336 aa  260  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31720  Sulfate-binding precursor protein  44.98 
 
 
332 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  48.03 
 
 
335 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5843  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.15 
 
 
341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.302205  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1638  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.65 
 
 
345 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.749782  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1223  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.44 
 
 
358 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  47.44 
 
 
335 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0899  sulfate starvation-induced protein 2  45.07 
 
 
338 aa  257  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0084  extracellular solute-binding protein  46.25 
 
 
336 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0120  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.2 
 
 
342 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1156  thiosulphate-binding protein  44.12 
 
 
329 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  43.97 
 
 
329 aa  255  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4739  thiosulphate-binding protein  46.45 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623695  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6755  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.98 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0194  thiosulphate-binding protein  45.6 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648325  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  43.77 
 
 
798 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0291  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.12 
 
 
335 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0308  sulfate-binding protein  45.95 
 
 
338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1636  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.81 
 
 
345 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.778191  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2803  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.33 
 
 
336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0169  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.9 
 
 
341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0814  sulfate-binding protein  41.69 
 
 
328 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1799  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.77 
 
 
356 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.689523  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2992  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.33 
 
 
339 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1923  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.77 
 
 
339 aa  252  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.436654  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0107  sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  43.45 
 
 
342 aa  252  8.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0241  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.26 
 
 
331 aa  251  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.276521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0325  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.58 
 
 
337 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0620  thiosulphate-binding protein  46.71 
 
 
336 aa  251  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000295034  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1517  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.13 
 
 
345 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1497  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.13 
 
 
345 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3046  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.71 
 
 
341 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.398245  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4806  sulfate transporter subunit  45.78 
 
 
331 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>