180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1652 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  69.62 
 
 
544 aa  784    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  100 
 
 
546 aa  1107    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  66.29 
 
 
538 aa  748    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3436  Radical SAM domain protein  69.04 
 
 
537 aa  770    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000587564 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  69.74 
 
 
540 aa  793    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  69.17 
 
 
537 aa  767    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4678  radical SAM domain-containing protein  69.36 
 
 
543 aa  783    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  69.36 
 
 
537 aa  769    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2669  Elongator protein 3/MiaB/NifB  59.43 
 
 
528 aa  627  1e-178  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0247408  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30001  Fe-S oxidoreductase  57.85 
 
 
532 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18361  Fe-S oxidoreductase  55.6 
 
 
513 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2298  Elongator protein 3/MiaB/NifB  59.08 
 
 
465 aa  548  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  35.91 
 
 
589 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  34.98 
 
 
589 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  34.8 
 
 
589 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  33.8 
 
 
559 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  34.87 
 
 
557 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  34.23 
 
 
544 aa  266  8.999999999999999e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  34.55 
 
 
593 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 
544 aa  263  6e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  32.97 
 
 
566 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  34.27 
 
 
613 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  32.33 
 
 
597 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 
624 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  31.14 
 
 
614 aa  252  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  32.56 
 
 
842 aa  250  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  32.62 
 
 
828 aa  250  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  32.09 
 
 
619 aa  249  7e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  32.36 
 
 
897 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 
633 aa  249  9e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  32.96 
 
 
563 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.86 
 
 
644 aa  247  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 
626 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  33.03 
 
 
563 aa  246  9e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  32.07 
 
 
638 aa  243  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  31.63 
 
 
642 aa  243  9e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3459  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 
663 aa  242  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  30.7 
 
 
618 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  30.11 
 
 
613 aa  242  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  32.34 
 
 
812 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  31.49 
 
 
657 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  31.3 
 
 
654 aa  238  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  31.44 
 
 
653 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  29.09 
 
 
613 aa  238  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  33.04 
 
 
655 aa  238  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  32.05 
 
 
640 aa  238  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  31.43 
 
 
557 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  31.54 
 
 
860 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  31.78 
 
 
636 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  32.68 
 
 
849 aa  233  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  31.89 
 
 
826 aa  233  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  33.91 
 
 
898 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  29.06 
 
 
551 aa  232  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  31.33 
 
 
842 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  33.91 
 
 
898 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  27.82 
 
 
628 aa  232  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  31.68 
 
 
626 aa  231  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14180  Fe-S oxidoreductase  32.92 
 
 
626 aa  231  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  33.72 
 
 
898 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 
663 aa  230  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  31.28 
 
 
828 aa  230  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3863  radical SAM domain-containing protein  31.94 
 
 
661 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.721561  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  31 
 
 
557 aa  229  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 
856 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 
857 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  31.8 
 
 
882 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  29.51 
 
 
617 aa  227  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  29.51 
 
 
617 aa  227  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2463  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 
640 aa  227  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.123021 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.24 
 
 
872 aa  227  5.0000000000000005e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5264  radical SAM domain-containing protein  31.99 
 
 
677 aa  226  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  30.71 
 
 
828 aa  226  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  29.85 
 
 
627 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  30.47 
 
 
910 aa  226  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  29.62 
 
 
610 aa  225  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  31.68 
 
 
573 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7280  Radical SAM domain protein  30.9 
 
 
645 aa  223  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  31.21 
 
 
836 aa  223  7e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  29.76 
 
 
611 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  32.81 
 
 
619 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  31.28 
 
 
852 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 
817 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.16 
 
 
860 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.74 
 
 
894 aa  219  8.999999999999998e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1216  radical SAM family protein  30.18 
 
 
679 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.837024  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.93 
 
 
887 aa  219  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06130  Fe-S oxidoreductase  29.72 
 
 
626 aa  218  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000171239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  31.79 
 
 
898 aa  218  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  29.82 
 
 
600 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  32.34 
 
 
874 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  30.65 
 
 
879 aa  217  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3383  Radical SAM domain protein  29.54 
 
 
645 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.660882  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  30.48 
 
 
545 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 
617 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  30.96 
 
 
510 aa  211  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1263  Radical SAM domain protein  31.01 
 
 
681 aa  210  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0245777  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  29.6 
 
 
600 aa  209  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  29.24 
 
 
971 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 
864 aa  207  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  28.55 
 
 
599 aa  204  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>