52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1640 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1640  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  359  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.676471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2515  hypothetical protein  52.57 
 
 
182 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246969  normal  0.112368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2977  protein of unknown function DUF901  52.81 
 
 
182 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2903  protein of unknown function DUF901  51.43 
 
 
180 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3193  protein of unknown function DUF901  51.43 
 
 
180 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.747154  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1227  hypothetical protein  50.88 
 
 
181 aa  169  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453712  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3775  hypothetical protein  49.14 
 
 
182 aa  164  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000635481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2712  protein of unknown function DUF901  45.56 
 
 
188 aa  150  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  hitchhiker  0.000000212739 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0087  hypothetical protein  35.59 
 
 
170 aa  91.7  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000109377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0089  protein of unknown function DUF901  35.84 
 
 
170 aa  89.4  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  27.33 
 
 
168 aa  88.6  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5213  hypothetical protein  33.71 
 
 
170 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800561  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0113  hypothetical protein  33.71 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2733  hypothetical protein  30.23 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2419  hypothetical protein  30.23 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0021218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0103  hypothetical protein  33.71 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.28353e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0092  hypothetical protein  33.71 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000150806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0123  hypothetical protein  33.71 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000156564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0092  hypothetical protein  33.71 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000731503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0088  hypothetical protein  33.71 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00128931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0092  hypothetical protein  33.71 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0113627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0089  hypothetical protein  33.71 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0087  hypothetical protein  33.71 
 
 
170 aa  84.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00076755  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2729  protein of unknown function DUF901  37.91 
 
 
169 aa  85.1  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  36.09 
 
 
888 aa  84.7  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  36.09 
 
 
880 aa  84.7  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0093  protein of unknown function DUF901  33.53 
 
 
170 aa  82  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0268  protein of unknown function DUF901  35.75 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000073026  normal  0.0102787 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  36.73 
 
 
882 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0175  protein of unknown function DUF901  32.78 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640725  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0849  hypothetical protein  30.12 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776394  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0210  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0191  hypothetical protein  36.02 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0177603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2480  hypothetical protein  31.82 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091226  hitchhiker  0.00317496 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0197  hypothetical protein  27.93 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000225035  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  34.87 
 
 
885 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0406  protein of unknown function DUF901  33.14 
 
 
158 aa  62  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000350703  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1643  protein of unknown function DUF901  31.28 
 
 
177 aa  58.5  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000139339  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0555  hypothetical protein  27.45 
 
 
174 aa  58.2  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0569  hypothetical protein  27.45 
 
 
174 aa  58.2  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.330291  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36358  predicted protein  29.49 
 
 
354 aa  57  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218477  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0123  RNA-binding protein  29.75 
 
 
159 aa  56.2  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2397  protein of unknown function DUF901  27.27 
 
 
180 aa  54.7  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.495635 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0173  hypothetical protein  29.92 
 
 
175 aa  54.3  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.236858  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30756  predicted protein  25.26 
 
 
374 aa  49.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19430  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain  27.74 
 
 
181 aa  44.7  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000111934 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03800  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  29.83 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000618341  normal  0.163612 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  27.43 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2171  hypothetical protein  29.84 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00990359  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2016  hypothetical protein  29.1 
 
 
124 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2062  hypothetical protein  29.1 
 
 
124 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2120  hypothetical protein  26.58 
 
 
170 aa  41.6  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>