115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1635 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  76.72 
 
 		 543 aa  802    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  100 
 
 		 548 aa  1095    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  49.74 
 
 		 531 aa  451  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  47.13 
 
 		 518 aa  437  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  38.86 
 
 		 624 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  39.03 
 
 		 510 aa  280  4e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  38.14 
 
 		 531 aa  280  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  36.97 
 
 		 513 aa  276  6e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  38.48 
 
 		 574 aa  273  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  36.66 
 
 		 542 aa  269  8.999999999999999e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  36.38 
 
 		 550 aa  266  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  37.87 
 
 		 500 aa  266  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  36.65 
 
 		 543 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  38.22 
 
 		 533 aa  263  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  36.5 
 
 		 539 aa  257  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  37.95 
 
 		 529 aa  257  4e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  35.79 
 
 		 491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  37.27 
 
 		 639 aa  255  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  37.06 
 
 		 571 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  37.8 
 
 		 563 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  35.64 
 
 		 524 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  33.68 
 
 		 555 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  36.77 
 
 		 658 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  34.23 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  35.66 
 
 		 622 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  33.63 
 
 		 581 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  33.63 
 
 		 581 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  35.69 
 
 		 572 aa  246  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  36.11 
 
 		 561 aa  244  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  33.22 
 
 		 586 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  33.22 
 
 		 586 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  34.15 
 
 		 581 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  36.83 
 
 		 561 aa  241  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  36.5 
 
 		 528 aa  240  4e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  34.57 
 
 		 530 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  35.93 
 
 		 531 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  35.02 
 
 		 551 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  35.03 
 
 		 518 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  33.65 
 
 		 641 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  34.44 
 
 		 604 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  33.27 
 
 		 591 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  32.66 
 
 		 593 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  34.19 
 
 		 578 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  32.94 
 
 		 643 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  34.85 
 
 		 629 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  33.52 
 
 		 600 aa  209  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  32.53 
 
 		 550 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  49.77 
 
 		 666 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  49.77 
 
 		 666 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  32.7 
 
 		 606 aa  194  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  39.12 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  30.32 
 
 		 589 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  31.38 
 
 		 568 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  28.65 
 
 		 508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  43.69 
 
 		 632 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  33.57 
 
 		 645 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  39.46 
 
 		 544 aa  167  4e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  52.5 
 
 		 188 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  47.78 
 
 		 527 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  29.48 
 
 		 515 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  32.94 
 
 		 450 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  37.21 
 
 		 515 aa  117  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  52.38 
 
 		 261 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  65.22 
 
 		 262 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  65.22 
 
 		 262 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  29.71 
 
 		 440 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  28.8 
 
 		 485 aa  89  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  25.06 
 
 		 415 aa  87.4  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  27.49 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  25.57 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  25.65 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  23.83 
 
 		 432 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  24.33 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  28.32 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  25.67 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  37.07 
 
 		 946 aa  66.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  24.23 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  24.93 
 
 		 390 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  35.71 
 
 		 673 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  24.54 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  36.14 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  33.33 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  27.81 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  32.32 
 
 		 932 aa  55.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  26.38 
 
 		 335 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  35.42 
 
 		 919 aa  55.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  30.05 
 
 		 355 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  25.18 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  38.57 
 
 		 784 aa  51.6  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  32.86 
 
 		 186 aa  51.2  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  37.88 
 
 		 536 aa  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  44.44 
 
 		 1036 aa  49.7  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  32.41 
 
 		 424 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  43.64 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  30.46 
 
 		 336 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  29.81 
 
 		 441 aa  49.3  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  30.77 
 
 		 330 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  32.43 
 
 		 1821 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  42.31 
 
 		 343 aa  48.9  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  45 
 
 		 575 aa  48.5  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>