11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1627 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1627  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  843    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0957516  normal  0.0248314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4219  hypothetical protein  46.19 
 
 
431 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000129718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0676  hypothetical protein  42.79 
 
 
442 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0695  hypothetical protein  42.79 
 
 
442 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0175017  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2365  hypothetical protein  40.59 
 
 
447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4514  hypothetical protein  43.61 
 
 
424 aa  286  7e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0643  hypothetical protein  39.96 
 
 
449 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.96808  hitchhiker  0.00878539 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10153  predicted protein  36.56 
 
 
409 aa  203  5e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.805896  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11883  predicted protein  32.13 
 
 
357 aa  142  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615976  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_93862  predicted protein  29.77 
 
 
573 aa  93.2  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.213448 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47095  predicted protein  27 
 
 
520 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>