26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1590 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1590  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  580  1.0000000000000001e-165  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.846445  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4728  hypothetical protein  54.04 
 
 
286 aa  307  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2159  hypothetical protein  50.7 
 
 
286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4445  protein of unknown function DUF1092  51.55 
 
 
293 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.414391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4383  protein of unknown function DUF1092  51.55 
 
 
293 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0060  protein of unknown function DUF1092  49.31 
 
 
290 aa  271  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1936  hypothetical protein  48.95 
 
 
286 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0781  protein of unknown function DUF1092  46.9 
 
 
288 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88180  psaB translation factor  37.54 
 
 
379 aa  205  5e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363654  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05321  hypothetical protein  38.6 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.440556  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07741  hypothetical protein  39.37 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.311592 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05851  hypothetical protein  36.97 
 
 
295 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.450432  normal  0.960414 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1638  hypothetical protein  36.01 
 
 
293 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1860  hypothetical protein  36.97 
 
 
295 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0995872  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11792  predicted protein  38.81 
 
 
278 aa  172  5.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.733277  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05931  hypothetical protein  33.45 
 
 
301 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0725  hypothetical protein  36.93 
 
 
294 aa  162  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05551  hypothetical protein  33.45 
 
 
301 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05851  hypothetical protein  32.4 
 
 
301 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0529  hypothetical protein  33.1 
 
 
301 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.784322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3687  hypothetical protein  34.04 
 
 
283 aa  132  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4636  hypothetical protein  29.47 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.190902  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1387  protein of unknown function DUF1092  29.97 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0136  hypothetical protein  28.14 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000036691  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4118  protein of unknown function DUF1092  30.51 
 
 
273 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4079  protein of unknown function DUF1092  30.51 
 
 
273 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>