13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1539 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1539  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  204  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.453632  normal  0.0148793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1796  hypothetical protein  45.95 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1664  hypothetical protein  46.97 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.606997  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0612  hypothetical protein  38.46 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3337  hypothetical protein  42.03 
 
 
95 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0021  hypothetical protein  39.13 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0597  hypothetical protein  35.9 
 
 
94 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1843  hypothetical protein  38.57 
 
 
90 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1396  hypothetical protein  36.71 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.233574  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2018  hypothetical protein  40.38 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4673  hypothetical protein  36.25 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.569025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2033  hypothetical protein  26.58 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.613799 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0193  hypothetical protein  28.95 
 
 
124 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>