20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1460 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1460  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  179  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0271116  decreased coverage  0.00664473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0760  hypothetical protein  70.59 
 
 		 82 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0185  hypothetical protein  67.06 
 
 		 82 aa  123  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.716458 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1063  hypothetical protein  65.88 
 
 		 82 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1971  Ycf34  64.71 
 
 		 82 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1998  hypothetical protein  64.71 
 
 		 82 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458681  normal  0.0607621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3834  hypothetical protein  64.71 
 
 		 82 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2998  putative protein Ycf34  61.18 
 
 		 82 aa  115  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.598628  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0301a  hypothetical protein  52.94 
 
 		 83 aa  100  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1506  putative Ycf34  54.76 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02121  putative Ycf34  51.19 
 
 		 83 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12681  hypothetical protein  45.88 
 
 		 83 aa  94  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.276714  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01681  putative Ycf34  47.06 
 
 		 83 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01551  putative Ycf34  50.59 
 
 		 83 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2391  hypothetical protein  53.57 
 
 		 83 aa  92.8  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01571  putative Ycf34  48.24 
 
 		 83 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01591  putative Ycf34  47.06 
 
 		 83 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.108018  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26601  putative Ycf34  47.62 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0142  putative Ycf34  43.53 
 
 		 83 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31741  predicted protein  47.62 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.74316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>