226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1440 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  100 
 
 		 306 aa  615  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  61.28 
 
 		 304 aa  359  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  59.06 
 
 		 304 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  57.43 
 
 		 305 aa  353  2.9999999999999997e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  62.07 
 
 		 302 aa  349  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  55 
 
 		 305 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  54.67 
 
 		 305 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  59.4 
 
 		 303 aa  329  3e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  47.18 
 
 		 315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  46.84 
 
 		 315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  46.03 
 
 		 315 aa  268  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  47.33 
 
 		 315 aa  265  7e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  46.31 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  46.67 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  45.6 
 
 		 316 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  43.42 
 
 		 315 aa  245  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  43.09 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  43.96 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  45.3 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  45.42 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  42.91 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  39.8 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  44.26 
 
 		 296 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  39.8 
 
 		 308 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  38.46 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  42.53 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  40.45 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  35.79 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  40.4 
 
 		 317 aa  195  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3124  homoserine kinase  41.45 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  43.86 
 
 		 313 aa  185  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0320  homoserine kinase  40.88 
 
 		 320 aa  185  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.234549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0885  homoserine kinase  38.7 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1023  homoserine kinase  43.77 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1201  homoserine kinase  40.74 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  34.54 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  39.31 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  38.67 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2894  homoserine kinase  37.09 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.710654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  36.21 
 
 		 304 aa  175  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1418  homoserine kinase  36.21 
 
 		 304 aa  175  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.011674  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  40.41 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  34.95 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  41.54 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1788  homoserine kinase  38.97 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.542876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  41.48 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  34.21 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0674  homoserine kinase  33.96 
 
 		 293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0444063  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  38.44 
 
 		 303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1074  homoserine kinase  34.29 
 
 		 287 aa  165  9e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000054772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1479  homoserine kinase  35.37 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1650  Homoserine kinase  36.02 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  36.24 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4151  homoserine kinase  43.38 
 
 		 321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1283  homoserine kinase  42.37 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46461  predicted protein  38.58 
 
 		 426 aa  159  7e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10263  predicted protein  39.85 
 
 		 265 aa  159  7e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111228  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0596  homoserine kinase  32.67 
 
 		 293 aa  159  8e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19320  homoserine kinase  40.89 
 
 		 304 aa  155  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1493  homoserine kinase  29.67 
 
 		 294 aa  155  9e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00125886  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  33.87 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3039  homoserine kinase  38.38 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2354  homoserine kinase  40.89 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000501713 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0129  homoserine kinase  31.21 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0169  homoserine kinase  31.21 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00243862  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1119  homoserine kinase  33.55 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0507  homoserine kinase  33.89 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0147  homoserine kinase  31.21 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00399009  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3936  homoserine kinase  40.74 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1007  homoserine kinase  42.01 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  33.8 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  29.08 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85224  homoserine kinase  28.98 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.481244  normal  0.37391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2422  homoserine kinase  38.31 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1300  homoserine kinase  38.95 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  34.16 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  34.16 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  34.16 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  34.16 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  34.16 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  34.16 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  34.16 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08843  homoserine kinase (Eurofung)  30 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  33.57 
 
 		 309 aa  146  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2463  homoserine kinase  41.3 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1746  homoserine kinase  39.37 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  33.81 
 
 		 310 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2621  homoserine kinase  36.33 
 
 		 305 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  33.81 
 
 		 310 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2053  homoserine kinase  32.33 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0296035  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0538  homoserine kinase  35.97 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.283285  unclonable  0.0000000181031 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  32.51 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  32.51 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  32.51 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  33.81 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  32.86 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  34.16 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0246  homoserine kinase  27.85 
 
 		 294 aa  142  7e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00137655  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  33.81 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  33.81 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>