More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1409 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  100 
 
 		 340 aa  702    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  56.69 
 
 		 349 aa  388  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  56.39 
 
 		 350 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  56.39 
 
 		 350 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  56.37 
 
 		 365 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  56.37 
 
 		 365 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  53.46 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  51.91 
 
 		 341 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  53.53 
 
 		 348 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  51.42 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  52.85 
 
 		 341 aa  339  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  47.56 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  43.44 
 
 		 355 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 337 aa  318  7e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  44.38 
 
 		 348 aa  308  6.999999999999999e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  48.47 
 
 		 337 aa  308  9e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  45.75 
 
 		 347 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  45.97 
 
 		 337 aa  301  7.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  43.79 
 
 		 342 aa  301  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  44.41 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  44.38 
 
 		 351 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  45.71 
 
 		 352 aa  299  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  45.57 
 
 		 345 aa  298  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  46.46 
 
 		 372 aa  298  7e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  44.18 
 
 		 347 aa  296  5e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  42.77 
 
 		 351 aa  295  6e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  44.11 
 
 		 334 aa  294  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  43.21 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  44.48 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  45.25 
 
 		 355 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  44.92 
 
 		 347 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  46.47 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16181  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  42.26 
 
 		 341 aa  285  8e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0774  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  42.18 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  43.11 
 
 		 349 aa  282  6.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 		 337 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  43.56 
 
 		 347 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  45.97 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  44.05 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  40.96 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  44.04 
 
 		 347 aa  276  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  44.04 
 
 		 349 aa  275  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  41.27 
 
 		 332 aa  275  8e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  42.9 
 
 		 335 aa  271  8.000000000000001e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  42.72 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12551  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  42.2 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.733876  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  41.46 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  42.51 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  43.63 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  42.15 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  42.46 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  38.75 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  39.83 
 
 		 347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  40.94 
 
 		 346 aa  266  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13311  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  42.04 
 
 		 340 aa  265  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.327656  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13611  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  40.6 
 
 		 340 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  38.79 
 
 		 351 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13521  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  41.72 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  40.29 
 
 		 349 aa  261  8.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  41.08 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  41.14 
 
 		 374 aa  260  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  39.88 
 
 		 337 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  41.56 
 
 		 372 aa  256  4e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1261  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  38.92 
 
 		 343 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  42.77 
 
 		 362 aa  255  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  41.64 
 
 		 333 aa  255  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  41.32 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  41.08 
 
 		 326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  39.37 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  40.69 
 
 		 333 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  39.68 
 
 		 334 aa  252  7e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  40.69 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  39.58 
 
 		 334 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  39.34 
 
 		 334 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  39.37 
 
 		 334 aa  249  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  40.06 
 
 		 333 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 		 333 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  40.66 
 
 		 335 aa  248  9e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  40.71 
 
 		 341 aa  246  3e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  39.83 
 
 		 380 aa  246  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  39.53 
 
 		 338 aa  245  8e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  41.19 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  40.88 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  37.61 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  41.01 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  40.69 
 
 		 351 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  40.69 
 
 		 351 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  39.94 
 
 		 335 aa  243  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  40.88 
 
 		 347 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  40.88 
 
 		 347 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  40.38 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  40.38 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  40.38 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  40.38 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  40.38 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  40.88 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  39.62 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  38.37 
 
 		 337 aa  239  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  39.94 
 
 		 347 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  39.62 
 
 		 336 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>