More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1408 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  100 
 
 		 213 aa  444  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  37.69 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  36.36 
 
 		 202 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  36.99 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.74 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 271 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  33.08 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  35.57 
 
 		 278 aa  88.6  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.24 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.9 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  38.06 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 268 aa  84.7  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  29.94 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  29.06 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.24 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.32 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.24 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  43.4 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.79 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2086  hypothetical protein  29.06 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.01 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.24 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  31.22 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.24 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30.54 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.61 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  42.61 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  38.78 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.59 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  32.28 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  26.04 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.81 
 
 		 321 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  34.81 
 
 		 310 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  38.78 
 
 		 629 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.08 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  31.84 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.56 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  27.78 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.93 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  30.1 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  32.7 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.91 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.46 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 335 aa  75.5  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 348 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  29.59 
 
 		 284 aa  75.1  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.7 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  34.55 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 		 270 aa  74.7  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 305 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 327 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.69 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.8 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.78 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  32.64 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  30.99 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.08 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 1162 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  35.97 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  30.27 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>