More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1356 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
151 aa  309  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  62.5 
 
 
151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  58.33 
 
 
150 aa  174  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  53.74 
 
 
152 aa  174  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  58.27 
 
 
160 aa  168  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  57.34 
 
 
152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  61.54 
 
 
173 aa  160  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  54.35 
 
 
146 aa  159  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  49.66 
 
 
165 aa  156  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.31 
 
 
146 aa  148  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  50.35 
 
 
145 aa  147  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  47.92 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  47.22 
 
 
150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  47.22 
 
 
150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  47.22 
 
 
150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  47.22 
 
 
150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  53.96 
 
 
153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  47.22 
 
 
150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  47.22 
 
 
150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  47.22 
 
 
150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  53.9 
 
 
151 aa  144  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  45.83 
 
 
148 aa  143  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  45.33 
 
 
154 aa  143  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  46.9 
 
 
154 aa  142  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  47.22 
 
 
150 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  45.77 
 
 
146 aa  141  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  47.55 
 
 
146 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  48.55 
 
 
149 aa  141  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  46.15 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  45 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  44.52 
 
 
149 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  45.95 
 
 
147 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  45.95 
 
 
147 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  45.95 
 
 
147 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  46.1 
 
 
148 aa  135  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  43.36 
 
 
145 aa  134  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  44.06 
 
 
145 aa  134  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  46.1 
 
 
144 aa  134  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  44.37 
 
 
146 aa  133  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  45.45 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  45.77 
 
 
139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  45.93 
 
 
146 aa  130  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  46.53 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  47.14 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  41.55 
 
 
146 aa  127  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  41.1 
 
 
148 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  44.37 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  45 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  42.14 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  43.15 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  47.73 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  45.58 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  42.75 
 
 
154 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  45.21 
 
 
148 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  44.2 
 
 
139 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  42.25 
 
 
149 aa  123  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  43.06 
 
 
145 aa  122  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  43.92 
 
 
148 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  44.37 
 
 
145 aa  120  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  41.43 
 
 
147 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  41.43 
 
 
147 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  41.1 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  43.66 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  41.73 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  41.38 
 
 
146 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  39.44 
 
 
155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  39.6 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  40 
 
 
148 aa  117  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  38.3 
 
 
149 aa  117  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  44.6 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  40.41 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  38.93 
 
 
162 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  38.57 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  41.01 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  46.77 
 
 
153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  43.06 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  41.01 
 
 
164 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  37.68 
 
 
154 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  38.41 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  41.01 
 
 
155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  37.76 
 
 
171 aa  110  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  41.78 
 
 
150 aa  110  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  43.06 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  39.44 
 
 
167 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  40.14 
 
 
143 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
151 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  37.76 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  37.68 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  42.65 
 
 
181 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3426  response regulator receiver protein  35.97 
 
 
154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  39.58 
 
 
153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  41.1 
 
 
145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  38.85 
 
 
147 aa  107  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  41.35 
 
 
153 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  42.75 
 
 
149 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  40.58 
 
 
153 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
153 aa  105  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
145 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  43.48 
 
 
151 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>