More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1351 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  100 
 
 
236 aa  473  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  48.58 
 
 
227 aa  207  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  46.08 
 
 
232 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  44.55 
 
 
229 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5452  HAD-superfamily hydrolase  44.39 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18961  phosphatase/phosphohexomutase  44.39 
 
 
225 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.452816 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06771  phosphatase/phosphohexomutase  35.29 
 
 
226 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0056  HAD family hydrolase  35.78 
 
 
226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.79 
 
 
227 aa  118  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35659  predicted protein  36.51 
 
 
267 aa  118  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  33.95 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  34.55 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15581  phosphatase/phosphohexomutase  32.61 
 
 
225 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59029  predicted protein  32.74 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318657  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1138  HAD family hydrolase  37.88 
 
 
216 aa  112  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  37.32 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  31.6 
 
 
227 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
396 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1319  HAD family hydrolase  39.56 
 
 
219 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  30.81 
 
 
216 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.39 
 
 
217 aa  105  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09497  HAD superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10760)  33.8 
 
 
296 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  37.57 
 
 
225 aa  102  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  37.57 
 
 
225 aa  102  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  33.51 
 
 
188 aa  99.8  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  30.41 
 
 
214 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  32.06 
 
 
223 aa  99.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.67 
 
 
222 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  33.33 
 
 
188 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  33.33 
 
 
188 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  33.33 
 
 
188 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  32.98 
 
 
188 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  33.33 
 
 
188 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  32.79 
 
 
188 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 
221 aa  96.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  32.79 
 
 
269 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  32.79 
 
 
188 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  28.38 
 
 
221 aa  96.3  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  32.79 
 
 
188 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  37.63 
 
 
219 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  32.24 
 
 
188 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  32.24 
 
 
188 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  32.24 
 
 
188 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  32.24 
 
 
188 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  32.46 
 
 
216 aa  95.1  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  33.33 
 
 
187 aa  95.1  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  26.64 
 
 
217 aa  95.1  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.24 
 
 
188 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  30.37 
 
 
188 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  32.29 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27350  HAD-superfamily hydrolase  35.87 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.77 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  30.89 
 
 
188 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.87 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.98 
 
 
227 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04170  conserved hypothetical protein  33.61 
 
 
251 aa  93.6  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.11 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  31.05 
 
 
217 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  31.94 
 
 
216 aa  92.8  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  26.17 
 
 
217 aa  92.8  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  34.2 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.72 
 
 
220 aa  92.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  31.22 
 
 
223 aa  92.4  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  31.35 
 
 
202 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  31.35 
 
 
202 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  32.62 
 
 
202 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  33.18 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0792  beta-phosphoglucomutase  30.84 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  34.01 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  32.61 
 
 
188 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.91 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.19 
 
 
217 aa  90.1  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.32 
 
 
235 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1305  beta-phosphoglucomutase  30.69 
 
 
223 aa  89.7  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.396501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  31.89 
 
 
188 aa  89.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  34.39 
 
 
224 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  30.91 
 
 
215 aa  89.4  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  34.38 
 
 
286 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  34.39 
 
 
224 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  34.39 
 
 
224 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  34.39 
 
 
224 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  34.39 
 
 
224 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  27.41 
 
 
216 aa  88.6  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.86 
 
 
224 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  32 
 
 
232 aa  88.6  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  27.98 
 
 
215 aa  88.6  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3281  HAD family hydrolase  37.09 
 
 
221 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  29.69 
 
 
219 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  32.66 
 
 
221 aa  88.2  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  29.23 
 
 
219 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  29.33 
 
 
221 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.09 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2733  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  33.51 
 
 
237 aa  87  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.53567  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.63 
 
 
200 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.83 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  29.69 
 
 
219 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1175  HAD family hydrolase  36.45 
 
 
263 aa  87  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>