More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1340 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  100 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  71.58 
 
 		 187 aa  272  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  71.04 
 
 		 187 aa  263  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  63.64 
 
 		 188 aa  253  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  64.64 
 
 		 187 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  62.77 
 
 		 187 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  62.77 
 
 		 187 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  62.84 
 
 		 187 aa  241  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  60.22 
 
 		 201 aa  232  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  56.98 
 
 		 201 aa  224  6e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  56.98 
 
 		 201 aa  224  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  56.67 
 
 		 201 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  56.91 
 
 		 201 aa  223  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  54.75 
 
 		 201 aa  221  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  55.19 
 
 		 201 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  54.86 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  54.29 
 
 		 202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  52.72 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  48.43 
 
 		 187 aa  154  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  48.43 
 
 		 187 aa  154  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  50.34 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  50.34 
 
 		 168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  50.7 
 
 		 171 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  50.69 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  50 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  51.39 
 
 		 175 aa  148  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  50.34 
 
 		 168 aa  148  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  54.07 
 
 		 168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  48.32 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  46.71 
 
 		 174 aa  145  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  53.33 
 
 		 168 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  53.33 
 
 		 168 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  54.81 
 
 		 167 aa  144  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  52.59 
 
 		 168 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  52.59 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  49.66 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  49.66 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  49.3 
 
 		 176 aa  138  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  48.59 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  49.64 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  47.59 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  46.72 
 
 		 172 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  43.75 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  49.29 
 
 		 173 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  51.03 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  48.67 
 
 		 173 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  47.44 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  48.91 
 
 		 175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  50.71 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  45.35 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  46.71 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  50 
 
 		 170 aa  132  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  44.37 
 
 		 164 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  48.77 
 
 		 170 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  57.02 
 
 		 152 aa  131  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  48.65 
 
 		 169 aa  131  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  48.99 
 
 		 176 aa  131  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  45.64 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  47.89 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  48.59 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  48.12 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  43.66 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0024  peptide deformylase  44 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  50.72 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  44.64 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  42.86 
 
 		 169 aa  129  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  46.98 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  45.45 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  48.12 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  43.03 
 
 		 178 aa  129  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  46.91 
 
 		 170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  46.91 
 
 		 170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  49.3 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  45.45 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  46.91 
 
 		 170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  46.91 
 
 		 170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  46.71 
 
 		 185 aa  128  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  47.4 
 
 		 168 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  45.75 
 
 		 167 aa  127  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  45.14 
 
 		 171 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  40.12 
 
 		 180 aa  127  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  43.95 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  43.95 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  46.9 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  45.1 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0024  peptide deformylase  43.27 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  47.06 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  45.07 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  42.86 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  45.07 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  49.65 
 
 		 156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  43.24 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  40.94 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  44.38 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  48.28 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  47.18 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  48.05 
 
 		 168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  48.05 
 
 		 168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  48.65 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  48.05 
 
 		 168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>