17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1338 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1338  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  513  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.193609  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4842  hypothetical protein  45.16 
 
 
287 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.329567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0039  hypothetical protein  42.92 
 
 
389 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4104  S-layer domain protein  40.38 
 
 
416 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4065  S-layer domain protein  40.38 
 
 
416 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1974  Sporulation domain protein  43.96 
 
 
362 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.160258  normal  0.0302087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1947  Sporulation domain protein  43.96 
 
 
362 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0411  hypothetical protein  43.72 
 
 
196 aa  159  4e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0683  S-layer domain protein  41.05 
 
 
412 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2272  hypothetical protein  44.77 
 
 
209 aa  156  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2943  hypothetical protein  43.81 
 
 
191 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03111  hypothetical protein  44.62 
 
 
247 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2520  hypothetical protein  36.56 
 
 
585 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0630  hypothetical protein  37.99 
 
 
380 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.313978  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27821  hypothetical protein  34.38 
 
 
245 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2467  hypothetical protein  35.29 
 
 
242 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2152  hypothetical protein  36.84 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>