115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1280 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  716    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  27.87 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  25.44 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  28.12 
 
 
708 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  22.16 
 
 
338 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  26.56 
 
 
395 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1808  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.22 
 
 
742 aa  63.2  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2369  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
173 aa  58.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  27.84 
 
 
734 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  27.84 
 
 
734 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  27.84 
 
 
733 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  31.91 
 
 
664 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  27.84 
 
 
733 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  28.35 
 
 
734 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  27.91 
 
 
372 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  27.91 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  27.91 
 
 
372 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26.32 
 
 
740 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  27.33 
 
 
374 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  27.32 
 
 
734 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  29.02 
 
 
360 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.91 
 
 
746 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  31.21 
 
 
664 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.43 
 
 
743 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  26.29 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  28.14 
 
 
676 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  22.96 
 
 
699 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  27.54 
 
 
371 aa  50.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2360  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.26 
 
 
639 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  27.92 
 
 
389 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.86 
 
 
641 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  28.03 
 
 
380 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  28.77 
 
 
363 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1378  protein of unknown function DUF939  29.09 
 
 
369 aa  50.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000180772  normal  0.221416 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  27.92 
 
 
389 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  29.03 
 
 
635 aa  49.7  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  28.03 
 
 
388 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  22.56 
 
 
679 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  22.56 
 
 
679 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  24.62 
 
 
698 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  27.08 
 
 
376 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  26.84 
 
 
662 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  27.19 
 
 
687 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  21.6 
 
 
677 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  26.13 
 
 
724 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  28.63 
 
 
361 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.56 
 
 
739 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.74 
 
 
679 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  22.56 
 
 
679 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  22.56 
 
 
679 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  28.38 
 
 
727 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  26.13 
 
 
724 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  25.52 
 
 
744 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  21.6 
 
 
679 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3662  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.11 
 
 
655 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.7 
 
 
730 aa  47  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3627  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.11 
 
 
655 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35242  normal  0.2133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.11 
 
 
655 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.374606  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3555  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.11 
 
 
655 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.11 
 
 
655 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.269228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2925  membrane protein-like protein  26.99 
 
 
749 aa  46.2  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119201  hitchhiker  0.0000166782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  25.91 
 
 
736 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  26.26 
 
 
697 aa  46.6  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  30.77 
 
 
733 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  30.77 
 
 
733 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  30.97 
 
 
733 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1355  protein of unknown function DUF939  16.59 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  30.77 
 
 
733 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  30.77 
 
 
733 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  30.77 
 
 
733 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  30.77 
 
 
733 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  30.77 
 
 
733 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.22 
 
 
745 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1402  hypothetical protein  22.15 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0595  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.37 
 
 
745 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2328  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.37 
 
 
745 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0873  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.37 
 
 
745 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  27.37 
 
 
745 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1024  putative fusaric acid resistance protein  27.37 
 
 
745 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1840  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.37 
 
 
745 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1207  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.8 
 
 
688 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00411304  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  25.41 
 
 
733 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  28.74 
 
 
662 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  24.63 
 
 
718 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1021  protein of unknown function DUF939  24.68 
 
 
368 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.61 
 
 
741 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45597  predicted protein  22.76 
 
 
582 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1427  hypothetical protein  23.85 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  25.65 
 
 
662 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.47 
 
 
722 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2854  protein of unknown function DUF939  20.63 
 
 
390 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150016  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  25.09 
 
 
711 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  26.67 
 
 
377 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  25 
 
 
670 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.12 
 
 
653 aa  44.3  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  32.09 
 
 
644 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.58 
 
 
655 aa  43.5  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3677  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.4 
 
 
655 aa  43.1  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  28.08 
 
 
662 aa  43.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.61 
 
 
655 aa  43.1  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>