More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1268 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  100 
 
 
484 aa  977    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  57.47 
 
 
479 aa  563  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  60.55 
 
 
490 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  58.4 
 
 
480 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  58.4 
 
 
480 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  61.73 
 
 
478 aa  549  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  59.54 
 
 
480 aa  541  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  58.05 
 
 
477 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  51.46 
 
 
487 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  51.14 
 
 
487 aa  428  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  47.66 
 
 
486 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  47.2 
 
 
486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  50.63 
 
 
487 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  45.47 
 
 
485 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  40.66 
 
 
486 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  39.29 
 
 
484 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  39.75 
 
 
484 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  39.92 
 
 
484 aa  353  5.9999999999999994e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.59 
 
 
469 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.93 
 
 
463 aa  340  5e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  40.72 
 
 
478 aa  336  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  41.04 
 
 
469 aa  326  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  39.41 
 
 
469 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.81 
 
 
475 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.42 
 
 
469 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.13 
 
 
469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  39.33 
 
 
468 aa  306  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  38.81 
 
 
488 aa  303  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  37.58 
 
 
474 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  36.81 
 
 
463 aa  295  9e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  36.91 
 
 
458 aa  295  1e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.41 
 
 
475 aa  288  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  37.89 
 
 
474 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  36.15 
 
 
471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  35.19 
 
 
470 aa  280  6e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.95 
 
 
473 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  34.76 
 
 
475 aa  277  3e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  34.54 
 
 
457 aa  277  3e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  34.78 
 
 
467 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.76 
 
 
470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  36.36 
 
 
472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.27 
 
 
475 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  33.48 
 
 
467 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.61 
 
 
460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  33.69 
 
 
467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  34.68 
 
 
460 aa  266  8e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  35.18 
 
 
471 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.62 
 
 
466 aa  261  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  34.26 
 
 
460 aa  259  9e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  34.04 
 
 
460 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  36.36 
 
 
460 aa  256  9e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  34.95 
 
 
460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  33.89 
 
 
486 aa  253  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  34.32 
 
 
460 aa  249  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.82 
 
 
474 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.02 
 
 
474 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.99 
 
 
472 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.12 
 
 
472 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.44 
 
 
472 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  32.85 
 
 
473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  33.33 
 
 
460 aa  234  3e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  37.68 
 
 
482 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  31.08 
 
 
472 aa  233  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  32.76 
 
 
414 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  30.29 
 
 
474 aa  230  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  33.08 
 
 
409 aa  226  9e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  34.6 
 
 
470 aa  225  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.65 
 
 
467 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  31.04 
 
 
501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.25 
 
 
484 aa  221  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.33 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  34.33 
 
 
503 aa  212  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  30.43 
 
 
465 aa  208  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.29 
 
 
472 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  28.45 
 
 
470 aa  200  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  31.17 
 
 
473 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  27.56 
 
 
470 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  27.77 
 
 
470 aa  194  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  28.3 
 
 
470 aa  193  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1292  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.72 
 
 
471 aa  192  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  32.7 
 
 
468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  29.86 
 
 
733 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  30.52 
 
 
451 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  26.67 
 
 
449 aa  154  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  30.33 
 
 
459 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  28.45 
 
 
452 aa  140  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  27.06 
 
 
444 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  29.02 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1019  phosphoglucosamine mutase  26.01 
 
 
447 aa  133  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  26.68 
 
 
451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  28.24 
 
 
449 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  28.03 
 
 
455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1762  phosphoglucosamine mutase  28.45 
 
 
451 aa  130  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  29.23 
 
 
458 aa  130  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2231  phosphoglucosamine mutase  26.93 
 
 
451 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2193  phosphoglucosamine mutase  26.93 
 
 
451 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.516388  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1152  phosphoglucosamine mutase  26.92 
 
 
448 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00023632  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0764  phosphoglucosamine mutase  27.23 
 
 
427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.882404  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  26.32 
 
 
458 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0606  alpha-phosphoglucomutase  27.59 
 
 
566 aa  128  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0586791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>