More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1260 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  551  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  45.56 
 
 
285 aa  225  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  45.93 
 
 
278 aa  220  2e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  42.86 
 
 
282 aa  214  1e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  45.02 
 
 
279 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  45.02 
 
 
279 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  44.16 
 
 
284 aa  199  4e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  40.64 
 
 
286 aa  179  6e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  40.17 
 
 
312 aa  136  3e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  37.7 
 
 
432 aa  134  1e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  39.91 
 
 
489 aa  132  8e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  41.35 
 
 
489 aa  131  1e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  39.9 
 
 
489 aa  129  8e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  39.01 
 
 
284 aa  125  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  36.06 
 
 
453 aa  125  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  36.55 
 
 
436 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.76404e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  34.75 
 
 
307 aa  122  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  35.35 
 
 
268 aa  122  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  36.7 
 
 
479 aa  120  2e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  34.11 
 
 
268 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.40796e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  39.56 
 
 
479 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  34.24 
 
 
264 aa  119  4e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  39.04 
 
 
513 aa  119  5e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  33.78 
 
 
490 aa  118  8e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  37.91 
 
 
493 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  38.78 
 
 
292 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  35.58 
 
 
424 aa  115  9e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  35.91 
 
 
478 aa  115  1e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  38.78 
 
 
292 aa  114  2e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  35.94 
 
 
294 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  31.55 
 
 
265 aa  112  7e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  35.65 
 
 
427 aa  111  1e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  35.96 
 
 
447 aa  111  1e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  34.15 
 
 
492 aa  110  2e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  31.49 
 
 
445 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
442 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  34.27 
 
 
320 aa  108  7e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  36.61 
 
 
489 aa  108  8e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  37.16 
 
 
529 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  33.64 
 
 
443 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  33.03 
 
 
262 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  35.81 
 
 
424 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  36.87 
 
 
494 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  31.25 
 
 
288 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  4.10475e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  32.37 
 
 
445 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  33.72 
 
 
500 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  32.39 
 
 
278 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  31.22 
 
 
266 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  4.70092e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  32.13 
 
 
365 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  3.43868e-06  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  35.38 
 
 
268 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  2.69933e-07 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  35.91 
 
 
504 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  30.92 
 
 
481 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
284 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 
483 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  33.19 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  31.94 
 
 
289 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  32.88 
 
 
262 aa  99  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  33.61 
 
 
392 aa  99  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  31.42 
 
 
470 aa  98.6  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.90245e-07  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  7.04965e-06  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  34.21 
 
 
280 aa  97.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  34.42 
 
 
493 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  29.81 
 
 
474 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  34.5 
 
 
479 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  31.17 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  30.08 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0989  peptidase M48 Ste24p  31.73 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168656  hitchhiker  0.00764497 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  30.09 
 
 
479 aa  96.7  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  33.02 
 
 
275 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  33.96 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  33.86 
 
 
481 aa  96.3  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  35.78 
 
 
493 aa  96.3  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  35.93 
 
 
270 aa  95.5  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  32.72 
 
 
263 aa  95.5  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  32.09 
 
 
288 aa  95.5  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  29.55 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 
472 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  30.88 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  31.71 
 
 
247 aa  95.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  35.88 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  32.86 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  30.94 
 
 
520 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  28.57 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  32.31 
 
 
423 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  29.68 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.30567e-07  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  29.02 
 
 
272 aa  94  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.66595e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 
496 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  33.03 
 
 
272 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 
497 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  30.05 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  33.03 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  33.87 
 
 
524 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  32.47 
 
 
488 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  33.03 
 
 
279 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  34.24 
 
 
280 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  32.51 
 
 
248 aa  92.4  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  6.17052e-06  hitchhiker  6.5256e-06 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  31.78 
 
 
490 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 
351 aa  91.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  31.34 
 
 
503 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  32.58 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>