More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1260 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  551  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  45.56 
 
 		 285 aa  225  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  45.93 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  42.86 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  45.02 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  45.02 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  44.16 
 
 		 284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  40.64 
 
 		 286 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  40.17 
 
 		 312 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  37.7 
 
 		 432 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  39.91 
 
 		 489 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  41.35 
 
 		 489 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  39.9 
 
 		 489 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  39.01 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  36.06 
 
 		 453 aa  125  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  36.55 
 
 		 436 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  35.35 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  34.75 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  36.7 
 
 		 479 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  34.11 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  39.56 
 
 		 479 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  34.24 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  39.04 
 
 		 513 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  33.78 
 
 		 490 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  37.91 
 
 		 493 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  38.78 
 
 		 292 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  35.58 
 
 		 424 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  35.91 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  38.78 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  35.94 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  31.55 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  35.96 
 
 		 447 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  35.65 
 
 		 427 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  34.15 
 
 		 492 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  31.49 
 
 		 445 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 442 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  34.27 
 
 		 320 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  36.61 
 
 		 489 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  37.16 
 
 		 529 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  33.64 
 
 		 443 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  33.03 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  35.81 
 
 		 424 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  36.87 
 
 		 494 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  31.25 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  32.37 
 
 		 445 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  32.39 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  33.72 
 
 		 500 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  31.22 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  32.13 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  35.91 
 
 		 504 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  35.38 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 483 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  30.92 
 
 		 481 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  31.94 
 
 		 289 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  33.19 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  32.88 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  33.61 
 
 		 392 aa  99  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  31.42 
 
 		 470 aa  98.6  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  34.21 
 
 		 280 aa  97.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  29.81 
 
 		 474 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  34.42 
 
 		 493 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  34.5 
 
 		 479 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  31.17 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  30.08 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  30.09 
 
 		 479 aa  96.7  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0989  peptidase M48 Ste24p  31.73 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168656  hitchhiker  0.00764497 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  33.96 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  33.02 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  33.86 
 
 		 481 aa  96.3  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  35.78 
 
 		 493 aa  96.3  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  35.93 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  32.72 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  32.09 
 
 		 288 aa  95.5  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  31.71 
 
 		 247 aa  95.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 		 472 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  35.88 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  29.55 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  30.88 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  29.68 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  30.94 
 
 		 520 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 		 496 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  32.31 
 
 		 423 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  29.02 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  32.86 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  28.57 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  30.05 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 		 497 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  33.03 
 
 		 272 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  33.03 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  33.87 
 
 		 524 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  33.03 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  32.47 
 
 		 488 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  34.24 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  32.51 
 
 		 248 aa  92.4  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 351 aa  91.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  31.78 
 
 		 490 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  31.34 
 
 		 503 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  29.95 
 
 		 376 aa  91.3  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>