More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1235 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  63.57 
 
 
746 aa  957    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  63.32 
 
 
727 aa  955    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  55.12 
 
 
743 aa  813    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  55.6 
 
 
743 aa  821    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  60.92 
 
 
757 aa  929    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  100 
 
 
729 aa  1511    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  63.36 
 
 
724 aa  926    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  63.43 
 
 
746 aa  955    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  62.17 
 
 
734 aa  928    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  46.85 
 
 
906 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  45.2 
 
 
716 aa  626  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  44.12 
 
 
1180 aa  618  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  43.22 
 
 
1188 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  45.26 
 
 
908 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  42.12 
 
 
1228 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  44.83 
 
 
906 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  46.24 
 
 
951 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  43 
 
 
1171 aa  592  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.83 
 
 
951 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  46.1 
 
 
951 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.96 
 
 
951 aa  592  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.96 
 
 
951 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.96 
 
 
951 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  45.98 
 
 
951 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  42.82 
 
 
1176 aa  591  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.96 
 
 
951 aa  592  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  43.85 
 
 
908 aa  588  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  44.54 
 
 
901 aa  587  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  43.7 
 
 
904 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  45.72 
 
 
1173 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  43.98 
 
 
905 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  43.41 
 
 
952 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  43.49 
 
 
931 aa  572  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.86 
 
 
1003 aa  575  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  44.03 
 
 
986 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  43.43 
 
 
953 aa  569  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  42.61 
 
 
954 aa  569  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  42.97 
 
 
952 aa  566  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.2 
 
 
907 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  42.13 
 
 
958 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  44.63 
 
 
929 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  42.38 
 
 
1395 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  42.24 
 
 
1397 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  42.11 
 
 
1397 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  42.44 
 
 
1409 aa  557  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  44.04 
 
 
1232 aa  558  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  42.24 
 
 
1395 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  42.11 
 
 
1395 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  42.24 
 
 
1395 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  42.02 
 
 
915 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  42.02 
 
 
915 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  44.12 
 
 
1342 aa  553  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  42.33 
 
 
955 aa  555  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  43.13 
 
 
879 aa  550  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  43.16 
 
 
894 aa  549  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  43.19 
 
 
933 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  44.03 
 
 
1405 aa  551  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  42.02 
 
 
1383 aa  551  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  42.09 
 
 
1338 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  41.05 
 
 
946 aa  551  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  42.37 
 
 
1396 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  43.84 
 
 
933 aa  548  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  41.75 
 
 
1407 aa  544  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  41.26 
 
 
1405 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.54 
 
 
906 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  42.32 
 
 
1401 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  42.9 
 
 
1384 aa  542  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  41.49 
 
 
1317 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4821  assimilatory nitrate reductase (NADH) large subunit  42.44 
 
 
915 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0576788  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  41.51 
 
 
1357 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  42.01 
 
 
1341 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  41.91 
 
 
1403 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  42.27 
 
 
1312 aa  537  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  43.83 
 
 
1370 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  42.11 
 
 
1418 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  42.11 
 
 
1418 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  42.25 
 
 
1398 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  42.19 
 
 
1427 aa  529  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  42.11 
 
 
1418 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  42.11 
 
 
1418 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  42.25 
 
 
1418 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  42.39 
 
 
1418 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0053  molybdopterin oxidoreductase  40.74 
 
 
658 aa  529  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  42.58 
 
 
1257 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2865  molybdopterin oxidoreductase  41.9 
 
 
894 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734148  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  41.8 
 
 
1313 aa  525  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1219  nitrate reductase large subunit oxidoreductase protein  40.47 
 
 
913 aa  521  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.557498  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3417  Nitrate reductase  42.76 
 
 
895 aa  521  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  41.13 
 
 
1400 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2954  molybdopterin oxidoreductase  43.27 
 
 
901 aa  518  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1627  molybdopterin oxidoreductase  40.17 
 
 
885 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169804  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3229  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  41 
 
 
1271 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00976953  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  42.78 
 
 
1394 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  41.27 
 
 
1271 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  40.52 
 
 
762 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4523  molybdopterin oxidoreductase  40.22 
 
 
885 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3291  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  41 
 
 
1271 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.362066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3546  Nitrate reductase  42.62 
 
 
895 aa  511  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528678  normal  0.381606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3749  nitrate reductase  42.88 
 
 
910 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391081  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2297  molybdopterin oxidoreductase  40.96 
 
 
898 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354488  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>