More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1197 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1197  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
295 aa  594  1e-169  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.075446  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.1 
 
 
296 aa  374  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.95 
 
 
293 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.95 
 
 
293 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.62 
 
 
295 aa  358  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.56 
 
 
295 aa  356  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.22 
 
 
294 aa  355  5.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  59.2 
 
 
297 aa  355  6.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.22 
 
 
294 aa  349  3e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.09 
 
 
295 aa  344  1e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5042  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.89 
 
 
302 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19771  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.33 
 
 
301 aa  329  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17161  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.58 
 
 
295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0863  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.24 
 
 
295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14961  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.32 
 
 
295 aa  291  8e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14821  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.32 
 
 
295 aa  288  6e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14581  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.66 
 
 
295 aa  288  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.65 
 
 
288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1393  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.64 
 
 
295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32358  predicted protein  49.53 
 
 
355 aa  281  1e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4892  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.99 
 
 
280 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.03 
 
 
273 aa  249  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3804  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.13 
 
 
291 aa  246  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.743841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.71 
 
 
268 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.57 
 
 
266 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
266 aa  235  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.91 
 
 
264 aa  232  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
262 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.06 
 
 
265 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  50 
 
 
267 aa  225  6e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.47 
 
 
271 aa  225  7e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.24 
 
 
264 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.55 
 
 
267 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.68 
 
 
263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.68 
 
 
263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.94 
 
 
263 aa  222  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.24 
 
 
266 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.86 
 
 
266 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.25 
 
 
266 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.89 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  47.33 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.04 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 
266 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.01 
 
 
271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.6 
 
 
259 aa  215  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.77 
 
 
268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.91 
 
 
269 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.58 
 
 
295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.17 
 
 
266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.86 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.63 
 
 
270 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.39 
 
 
273 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.39 
 
 
268 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.07 
 
 
267 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.71 
 
 
264 aa  209  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.63 
 
 
269 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.28 
 
 
270 aa  209  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.12 
 
 
266 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.1 
 
 
265 aa  209  5e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.74 
 
 
270 aa  208  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.97 
 
 
271 aa  208  8e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.55 
 
 
285 aa  208  9e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.03 
 
 
265 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.33 
 
 
264 aa  208  9e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.26 
 
 
269 aa  208  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1897  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.73 
 
 
263 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.42 
 
 
261 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.31 
 
 
267 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.49 
 
 
259 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.49 
 
 
259 aa  206  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.32 
 
 
285 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
276 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.24 
 
 
265 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.59 
 
 
278 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.32 
 
 
285 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.63 
 
 
271 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.59 
 
 
278 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.71 
 
 
264 aa  206  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.37 
 
 
266 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2562  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.74 
 
 
279 aa  206  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00548778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.08 
 
 
278 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.13 
 
 
266 aa  205  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.87 
 
 
258 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.93 
 
 
287 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.87 
 
 
266 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.45 
 
 
277 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.59 
 
 
278 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.1 
 
 
270 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.49 
 
 
267 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.27 
 
 
266 aa  203  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.32 
 
 
272 aa  202  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  44.4 
 
 
268 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.45 
 
 
285 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.98 
 
 
268 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.56 
 
 
262 aa  202  7e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.61 
 
 
278 aa  202  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.11 
 
 
279 aa  202  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.42 
 
 
268 aa  201  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.06 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>