90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1140 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  55.01 
 
 		 584 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  55.35 
 
 		 584 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  100 
 
 		 585 aa  1186    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  57.51 
 
 		 599 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  55.97 
 
 		 595 aa  617  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  55.08 
 
 		 582 aa  612  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  41.87 
 
 		 595 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  42.02 
 
 		 595 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  40.21 
 
 		 601 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  29.16 
 
 		 527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  28.34 
 
 		 619 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  24.09 
 
 		 514 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 534 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  28.9 
 
 		 549 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  28.16 
 
 		 531 aa  97.8  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  22.4 
 
 		 595 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  27.19 
 
 		 621 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  28.06 
 
 		 530 aa  94.7  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  27.36 
 
 		 595 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 538 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  22.75 
 
 		 531 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.26 
 
 		 540 aa  91.3  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  23.26 
 
 		 550 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  26.73 
 
 		 532 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  23.73 
 
 		 547 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  21.77 
 
 		 680 aa  83.6  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  25.33 
 
 		 568 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  21.98 
 
 		 543 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  24.85 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  25.26 
 
 		 748 aa  82.4  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  25.05 
 
 		 758 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  24.96 
 
 		 675 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  24.51 
 
 		 696 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  22.2 
 
 		 668 aa  77.8  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  24.75 
 
 		 764 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  24.51 
 
 		 696 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  24.32 
 
 		 672 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  24.84 
 
 		 757 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  23.59 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  26.3 
 
 		 641 aa  73.9  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  24.49 
 
 		 454 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 		 537 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  24.17 
 
 		 661 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  26.6 
 
 		 660 aa  70.9  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  31.98 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  23.55 
 
 		 692 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  22.57 
 
 		 549 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  25.06 
 
 		 669 aa  67.4  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  24.9 
 
 		 784 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  28.19 
 
 		 706 aa  63.9  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  26.16 
 
 		 761 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  24.02 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  21.54 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  25.94 
 
 		 679 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 443 aa  56.6  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  25.39 
 
 		 764 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  31.09 
 
 		 797 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  24.83 
 
 		 432 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  29.41 
 
 		 606 aa  56.2  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 676 aa  56.2  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.32 
 
 		 600 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  25.52 
 
 		 679 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  24.35 
 
 		 691 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.16 
 
 		 472 aa  53.9  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  54.35 
 
 		 456 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  29.17 
 
 		 435 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  21.44 
 
 		 431 aa  52  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0977  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.54 
 
 		 561 aa  51.6  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  22.75 
 
 		 445 aa  51.2  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 		 468 aa  51.2  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.5 
 
 		 722 aa  50.8  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  30.86 
 
 		 624 aa  50.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  24.14 
 
 		 763 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  26.8 
 
 		 600 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  28.73 
 
 		 445 aa  48.9  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1023  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.89 
 
 		 685 aa  48.5  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0004  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  28.41 
 
 		 631 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5306  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  28.41 
 
 		 630 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  51.16 
 
 		 551 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 457 aa  44.3  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1000  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  30.56 
 
 		 778 aa  43.9  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 441 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0552  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  23.94 
 
 		 786 aa  43.9  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0563725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5442  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  27.84 
 
 		 630 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0510  pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  44.9 
 
 		 470 aa  43.9  0.009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0251745  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 433 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>