248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1119 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  435  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  58.62 
 
 
239 aa  247  9e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  54.85 
 
 
264 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  49.76 
 
 
250 aa  218  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  53.4 
 
 
242 aa  216  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  55.5 
 
 
209 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  55.5 
 
 
209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  53.52 
 
 
229 aa  204  8e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  51.18 
 
 
242 aa  203  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  51.96 
 
 
238 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  43.5 
 
 
207 aa  157  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  39.57 
 
 
213 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.75 
 
 
238 aa  142  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  44.57 
 
 
199 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  44.51 
 
 
206 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  48.08 
 
 
229 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  47.13 
 
 
308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  51.09 
 
 
304 aa  128  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  38.46 
 
 
266 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  45.4 
 
 
325 aa  127  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  35.47 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  37.91 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  41.67 
 
 
320 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  42.68 
 
 
174 aa  121  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  36.19 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  44.08 
 
 
623 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  33.5 
 
 
198 aa  118  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  33.84 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  32.49 
 
 
198 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  40.99 
 
 
222 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18721  hypothetical protein  35.67 
 
 
203 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  44.3 
 
 
149 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  46.85 
 
 
240 aa  101  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 
231 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  37.38 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  36.9 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  42.31 
 
 
225 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  31.64 
 
 
236 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  31.64 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.64 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  31.64 
 
 
236 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  31.64 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  31.64 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  31.64 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  32.41 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  31.07 
 
 
236 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  43.92 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  36.3 
 
 
192 aa  95.9  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  36.36 
 
 
232 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  39.52 
 
 
224 aa  92.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  38.62 
 
 
227 aa  91.7  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  38.62 
 
 
227 aa  91.7  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  33.88 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  40.29 
 
 
226 aa  88.6  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  43.22 
 
 
234 aa  88.6  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  36.11 
 
 
722 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  36.88 
 
 
716 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.73 
 
 
713 aa  86.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.85 
 
 
722 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43839  predicted protein  34.78 
 
 
409 aa  86.3  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.416143  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.53 
 
 
746 aa  85.9  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  32.92 
 
 
225 aa  85.9  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  33.79 
 
 
713 aa  85.5  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.85 
 
 
722 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  37.58 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  31.28 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.13 
 
 
705 aa  82.8  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  35.88 
 
 
716 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  31.93 
 
 
738 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  32.99 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  38.19 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  34.9 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  32.98 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  32.47 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  39.24 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.36 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1332  SNARE associated Golgi protein  44.53 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  38.3 
 
 
717 aa  78.6  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  42.37 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0621  hypothetical protein  32.02 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1430  SNARE associated Golgi protein  44.53 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.159298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  33.78 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.62 
 
 
283 aa  78.2  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  35.48 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  37.58 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.97 
 
 
717 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  35.48 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  32.61 
 
 
704 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  41.27 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  31.38 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  33.93 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  33.93 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  35.46 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.17 
 
 
717 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  36.62 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  32.74 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.38 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  32.84 
 
 
735 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>