252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1114 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1114  ribosomal biogenesis GTPase  100 
 
 		 287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.44359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  61.92 
 
 		 293 aa  357  9.999999999999999e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  59.44 
 
 		 281 aa  353  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  59.43 
 
 		 285 aa  348  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  59.72 
 
 		 281 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2557  ribosomal biogenesis GTPase  63.61 
 
 		 327 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4647  ribosomal biogenesis GTPase  62.28 
 
 		 293 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  59.72 
 
 		 281 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27991  ribosomal biogenesis GTPase  60.21 
 
 		 289 aa  318  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1561  ribosomal biogenesis GTPase  55.75 
 
 		 287 aa  318  6e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  55.75 
 
 		 287 aa  318  7.999999999999999e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2142  ribosomal biogenesis GTPase  59.17 
 
 		 292 aa  306  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02121  ribosomal biogenesis GTPase  53.31 
 
 		 287 aa  301  9e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2458  ribosomal biogenesis GTPase  59.52 
 
 		 288 aa  299  3e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02121  ribosomal biogenesis GTPase  46.34 
 
 		 290 aa  285  9e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269316  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0196  ribosomal biogenesis GTPase  45.99 
 
 		 290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  51.76 
 
 		 369 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02141  ribosomal biogenesis GTPase  45.64 
 
 		 290 aa  281  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.909722  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02231  ribosomal biogenesis GTPase  47.04 
 
 		 288 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  34.62 
 
 		 296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  34.62 
 
 		 296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  34.62 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  34.62 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  35.59 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  33.33 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  35.62 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  34.27 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  34.27 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  33.92 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  35.42 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  33.92 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  34.27 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  33.92 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  34.36 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  31.12 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  33.57 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  36.36 
 
 		 283 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  31.85 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  32.3 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  32.53 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  32.53 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  34.38 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  32.52 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  32.52 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  34.39 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0764  GTP-binding protein YlqF  33.33 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  34.01 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  33.45 
 
 		 278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1416  ribosomal biogenesis GTPase  33.1 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00443588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  34.48 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  32.03 
 
 		 284 aa  155  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  33.45 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1013  ribosomal biogenesis GTPase  30.42 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.47 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  29.14 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.04 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  31.41 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  31.94 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  28.52 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1018  GTPase  31.47 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.447609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  34.55 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.87 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  32.39 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1227  GTP-binding protein HSR1-related  32.64 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  28.37 
 
 		 310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  31.53 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  32.87 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  33.56 
 
 		 329 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  28.52 
 
 		 312 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  32.3 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2120  GTPase  33.45 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  25.89 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  28.77 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  29.01 
 
 		 313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  28.77 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1688  GTP-binding protein HSR1-related  29.18 
 
 		 341 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  27.27 
 
 		 315 aa  128  9.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  27.36 
 
 		 314 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  29.27 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  29.27 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0543  GTPase family protein  28.87 
 
 		 316 aa  126  3e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  27.8 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1312  GTP-binding protein, HSR1-related  32.17 
 
 		 319 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  28.57 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  30.07 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  31.38 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1388  GTP-binding  31.14 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  28.38 
 
 		 314 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  28.23 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  28.23 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  28.23 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  28.42 
 
 		 313 aa  122  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  27.54 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  28.23 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3629  GTP-binding protein HSR1-related  29.39 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  30.49 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3396  GTP-binding  29.55 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  31.71 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  30.77 
 
 		 319 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  27.03 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>