More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1079 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.23 
 
 
846 aa  805    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.51 
 
 
815 aa  799    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.14 
 
 
815 aa  684    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.9 
 
 
846 aa  792    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.52 
 
 
818 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.71 
 
 
822 aa  1048    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1244  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.35 
 
 
850 aa  789    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.912337  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.1 
 
 
812 aa  835    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.32 
 
 
818 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
817 aa  1639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.87 
 
 
818 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.88 
 
 
818 aa  1055    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  64.22 
 
 
827 aa  1048    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  64.17 
 
 
819 aa  1065    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.91 
 
 
827 aa  1018    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  64.17 
 
 
819 aa  1065    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.72 
 
 
822 aa  1054    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.9 
 
 
846 aa  791    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.58 
 
 
786 aa  601  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.56 
 
 
832 aa  583  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.58 
 
 
767 aa  578  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.18 
 
 
829 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  40.81 
 
 
818 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.87 
 
 
765 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.87 
 
 
818 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.85 
 
 
700 aa  569  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.55 
 
 
779 aa  568  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.98 
 
 
702 aa  564  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.29 
 
 
683 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.2 
 
 
714 aa  561  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.74 
 
 
787 aa  561  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.57 
 
 
685 aa  562  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.21 
 
 
740 aa  557  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.65 
 
 
689 aa  558  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.37 
 
 
842 aa  556  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.62 
 
 
681 aa  556  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.86 
 
 
717 aa  555  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.81 
 
 
862 aa  552  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.65 
 
 
685 aa  549  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.04 
 
 
842 aa  552  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.46 
 
 
772 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.58 
 
 
679 aa  552  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.96 
 
 
778 aa  549  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.46 
 
 
772 aa  545  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.55 
 
 
682 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.35 
 
 
680 aa  540  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.91 
 
 
712 aa  536  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.7 
 
 
903 aa  539  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.74 
 
 
776 aa  537  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.15 
 
 
776 aa  538  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.88 
 
 
781 aa  533  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.17 
 
 
695 aa  532  1e-150  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.03 
 
 
682 aa  535  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.17 
 
 
706 aa  532  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.82 
 
 
763 aa  526  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  41.98 
 
 
700 aa  529  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.28 
 
 
682 aa  522  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.69 
 
 
706 aa  523  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.28 
 
 
682 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.34 
 
 
681 aa  523  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.28 
 
 
682 aa  522  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.28 
 
 
682 aa  522  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.45 
 
 
682 aa  519  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.28 
 
 
682 aa  522  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.28 
 
 
682 aa  522  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.82 
 
 
701 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.82 
 
 
696 aa  522  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.22 
 
 
779 aa  521  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.73 
 
 
694 aa  521  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.6 
 
 
682 aa  519  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.04 
 
 
686 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.09 
 
 
691 aa  515  1e-144  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.69 
 
 
685 aa  515  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.78 
 
 
657 aa  513  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.94 
 
 
690 aa  513  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.89 
 
 
773 aa  510  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.27 
 
 
703 aa  509  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.03 
 
 
772 aa  512  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.09 
 
 
702 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.83 
 
 
688 aa  512  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.66 
 
 
904 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.55 
 
 
703 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.05 
 
 
689 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.75 
 
 
805 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.84 
 
 
704 aa  507  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.29 
 
 
706 aa  502  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.92 
 
 
698 aa  505  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.54 
 
 
706 aa  504  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.82 
 
 
712 aa  501  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.59 
 
 
678 aa  499  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.08 
 
 
904 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.36 
 
 
691 aa  500  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.8 
 
 
799 aa  496  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.44 
 
 
671 aa  496  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.24 
 
 
720 aa  498  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1371  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.77 
 
 
710 aa  496  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.393956  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.66 
 
 
691 aa  499  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.19 
 
 
719 aa  497  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.65 
 
 
692 aa  499  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.51 
 
 
707 aa  497  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>