60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1063 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1063  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  164  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000299029  normal  0.0436362 
 
 
 
NC_007604  Synpcc7942_1062  hypothetical protein  63.41 
 
 
75 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144683  normal  0.0450083 
 
 
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  58.54 
 
 
311 aa  85.5  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_011726  PCC8801_3554  hypothetical protein  51.39 
 
 
276 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2559  hypothetical protein  51.39 
 
 
276 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.789765  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5809  hypothetical protein  50.75 
 
 
284 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1243  hypothetical protein  48 
 
 
288 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1818  hypothetical protein  51.43 
 
 
280 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.937622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  61.22 
 
 
311 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1515  hypothetical protein  48.53 
 
 
275 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1542  hypothetical protein  48.53 
 
 
275 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.966764  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3467  hypothetical protein  40.58 
 
 
301 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432253  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5118  hypothetical protein  44.93 
 
 
291 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3060  hypothetical protein  43.28 
 
 
280 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  46.15 
 
 
334 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2808  hypothetical protein  41.79 
 
 
85 aa  57  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3564  hypothetical protein  48.39 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0951658  normal  0.295077 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0368  hypothetical protein  40.54 
 
 
287 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.730391  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  40.24 
 
 
310 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  35.8 
 
 
313 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1724  hypothetical protein  39.13 
 
 
280 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.377801  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4873  hypothetical protein  45.21 
 
 
286 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4509  hypothetical protein  41.67 
 
 
303 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4879  hypothetical protein  41.43 
 
 
196 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0167  hypothetical protein  50.91 
 
 
290 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3814  hypothetical protein  52.94 
 
 
261 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.04819  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  34.52 
 
 
317 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5057  hypothetical protein  46.03 
 
 
86 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  38.81 
 
 
315 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  39.24 
 
 
318 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  50.63 
 
 
319 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  50.63 
 
 
319 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1249  hypothetical protein  39.24 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  35.71 
 
 
311 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  39.13 
 
 
315 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  36.78 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  44.44 
 
 
304 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3371  hypothetical protein  57.14 
 
 
284 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  37.84 
 
 
382 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  37.84 
 
 
382 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1071  hypothetical protein  48.08 
 
 
294 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  35.16 
 
 
330 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  37.84 
 
 
326 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2442  hypothetical protein  40.38 
 
 
296 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  hitchhiker  0.000000122281 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5391  hypothetical protein  46.88 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.566383  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4405  hypothetical protein  51.92 
 
 
305 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2641  hypothetical protein  53.85 
 
 
41 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  41.54 
 
 
320 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0807  hypothetical protein  41.03 
 
 
279 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1699  hypothetical protein  38.18 
 
 
288 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  33.77 
 
 
309 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1883  hypothetical protein  41.67 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  32.39 
 
 
306 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  40 
 
 
201 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  32.31 
 
 
343 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  30.23 
 
 
339 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3810  hypothetical protein  37.1 
 
 
274 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00863066  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  31.75 
 
 
331 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  34.92 
 
 
302 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4234  hypothetical protein  36.54 
 
 
59 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000176119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>