More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1060 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  57.4 
 
 		 607 aa  668    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  100 
 
 		 675 aa  1383    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  76.74 
 
 		 580 aa  945    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  72.37 
 
 		 611 aa  906    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  54.79 
 
 		 586 aa  640    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  51.44 
 
 		 661 aa  632  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  53.34 
 
 		 583 aa  621  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  51.52 
 
 		 661 aa  620  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  60.34 
 
 		 806 aa  610  1e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  63.06 
 
 		 673 aa  608  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  62.13 
 
 		 655 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  52.26 
 
 		 569 aa  600  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  59.72 
 
 		 777 aa  590  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  61.1 
 
 		 658 aa  591  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  60.6 
 
 		 683 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  58.14 
 
 		 670 aa  576  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  58.61 
 
 		 661 aa  565  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  59.49 
 
 		 659 aa  567  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  58.88 
 
 		 673 aa  561  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  46.88 
 
 		 661 aa  551  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  44.99 
 
 		 644 aa  550  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  56.58 
 
 		 680 aa  547  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  54.43 
 
 		 676 aa  532  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  54.43 
 
 		 676 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  47.34 
 
 		 592 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  52.16 
 
 		 676 aa  527  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  48.04 
 
 		 589 aa  524  1e-147  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  52.23 
 
 		 708 aa  518  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  54.99 
 
 		 663 aa  504  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  47.04 
 
 		 587 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  49 
 
 		 725 aa  495  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  48.51 
 
 		 728 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  51.59 
 
 		 659 aa  488  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  51.33 
 
 		 686 aa  488  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  49.49 
 
 		 709 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  45.45 
 
 		 608 aa  475  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  40 
 
 		 636 aa  437  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  41.1 
 
 		 647 aa  435  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  45.49 
 
 		 552 aa  429  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  47.04 
 
 		 675 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  44.68 
 
 		 675 aa  415  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  46.4 
 
 		 677 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  39.9 
 
 		 799 aa  409  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  44.47 
 
 		 778 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  43.7 
 
 		 793 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  43.55 
 
 		 829 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  45.69 
 
 		 710 aa  388  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  43.32 
 
 		 794 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  42.88 
 
 		 783 aa  386  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  42.99 
 
 		 787 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  46.48 
 
 		 790 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  44.83 
 
 		 793 aa  375  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  39.63 
 
 		 725 aa  367  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  44.91 
 
 		 763 aa  361  2e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  39.76 
 
 		 691 aa  345  2e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  52.82 
 
 		 316 aa  316  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  62.5 
 
 		 371 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  72.67 
 
 		 356 aa  225  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  32.94 
 
 		 697 aa  199  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  32.21 
 
 		 633 aa  186  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  31.28 
 
 		 574 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  31.01 
 
 		 574 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  30.61 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  30.79 
 
 		 496 aa  180  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  29.39 
 
 		 574 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  31.08 
 
 		 508 aa  174  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  31.08 
 
 		 523 aa  174  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  28.38 
 
 		 498 aa  173  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  29.41 
 
 		 495 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  29.21 
 
 		 504 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  26.95 
 
 		 499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  31.56 
 
 		 585 aa  164  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  30.07 
 
 		 505 aa  164  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  28.06 
 
 		 499 aa  164  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  29.54 
 
 		 498 aa  160  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  28.07 
 
 		 493 aa  157  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  28.54 
 
 		 822 aa  157  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  29 
 
 		 500 aa  156  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  33.54 
 
 		 505 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  29.68 
 
 		 568 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  28.67 
 
 		 505 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.02 
 
 		 508 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  33.33 
 
 		 808 aa  144  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  29.12 
 
 		 522 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  25.99 
 
 		 526 aa  144  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.03 
 
 		 538 aa  143  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  28.88 
 
 		 496 aa  143  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.67 
 
 		 708 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  28.17 
 
 		 504 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.98 
 
 		 549 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  27.7 
 
 		 522 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  27.91 
 
 		 495 aa  140  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  28.22 
 
 		 527 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  29.08 
 
 		 508 aa  140  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  27.33 
 
 		 511 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  33 
 
 		 799 aa  139  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  28.14 
 
 		 516 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  29.45 
 
 		 503 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 		 522 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  29.62 
 
 		 492 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>