More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1029 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 304 aa  626  1e-178  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  72.28 
 
 		 304 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  72.28 
 
 		 304 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  72.94 
 
 		 304 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  69.77 
 
 		 304 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  69.31 
 
 		 304 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  67.11 
 
 		 304 aa  437  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  68.32 
 
 		 304 aa  437  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  67.66 
 
 		 304 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  66.78 
 
 		 304 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14901  branched-chain amino acid aminotransferase  67 
 
 		 306 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0332  branched-chain amino acid aminotransferase  66.78 
 
 		 304 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0235876  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10051  branched-chain amino acid aminotransferase  67.11 
 
 		 304 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.299148 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  65.68 
 
 		 305 aa  427  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  66.34 
 
 		 304 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  39.74 
 
 		 307 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  39.54 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  39 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  38.67 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  38.83 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  39.53 
 
 		 311 aa  228  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  39.47 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  39.4 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  38 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  38.24 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  37.5 
 
 		 303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  39.07 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  38.26 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  37.58 
 
 		 307 aa  198  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  35.2 
 
 		 308 aa  195  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  37.13 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0740  Branched-chain-amino-acid transaminase  36.81 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  37.58 
 
 		 307 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  36.54 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  38.33 
 
 		 306 aa  192  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  35.53 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  39 
 
 		 319 aa  192  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  38.31 
 
 		 312 aa  192  7e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  35.64 
 
 		 308 aa  192  9e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  35.64 
 
 		 308 aa  192  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  35.64 
 
 		 308 aa  192  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  35.05 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  40.29 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  34.77 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  38.1 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  37.29 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  35.2 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  35.2 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  35.2 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  35.2 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  35.2 
 
 		 309 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  37 
 
 		 317 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  34.95 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  34.54 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  35.45 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  33.88 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  33.88 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3128  branched chain amino acid aminotransferase  35.2 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  37.33 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  36.16 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  34.88 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  34.19 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  35.83 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  34.19 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  35.23 
 
 		 313 aa  185  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  33.99 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  35.69 
 
 		 309 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  34.43 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  34 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  34 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  34 
 
 		 307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  34 
 
 		 307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  35.57 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  34.31 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  34.33 
 
 		 307 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  34.34 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  33.99 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  33.23 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  33.66 
 
 		 312 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  34.75 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  33.67 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  34.68 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  34.41 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  35.91 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  33.44 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  33.44 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  34.43 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>