149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1000 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  100 
 
 		 1076 aa  2107    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.74 
 
 		 1073 aa  1044    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.94 
 
 		 1052 aa  452  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.16 
 
 		 1795 aa  432  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.06 
 
 		 647 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.74 
 
 		 592 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.99 
 
 		 788 aa  352  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  36.99 
 
 		 788 aa  350  6e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.82 
 
 		 788 aa  350  7e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.33 
 
 		 790 aa  348  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.82 
 
 		 788 aa  348  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  36.64 
 
 		 788 aa  348  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1075  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.82 
 
 		 583 aa  348  3e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  36.64 
 
 		 788 aa  348  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  36.64 
 
 		 788 aa  348  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.64 
 
 		 788 aa  347  7e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.64 
 
 		 788 aa  346  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.58 
 
 		 940 aa  320  7.999999999999999e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3663  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.32 
 
 		 586 aa  313  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00731274  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  39.31 
 
 		 802 aa  313  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.85 
 
 		 810 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0195  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.93 
 
 		 821 aa  306  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1932  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.33 
 
 		 802 aa  289  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09210)  33.39 
 
 		 600 aa  255  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.85 
 
 		 1148 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0085  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.36 
 
 		 598 aa  221  7.999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.84 
 
 		 1148 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1073  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.62 
 
 		 597 aa  204  7e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.81 
 
 		 942 aa  163  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  49.38 
 
 		 466 aa  150  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  48.81 
 
 		 596 aa  147  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  29.34 
 
 		 795 aa  142  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.59 
 
 		 868 aa  142  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  43.98 
 
 		 442 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  29.56 
 
 		 780 aa  132  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.18 
 
 		 1266 aa  131  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  29.51 
 
 		 780 aa  131  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  26.95 
 
 		 1346 aa  127  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.66 
 
 		 601 aa  124  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  50.68 
 
 		 844 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  27.11 
 
 		 948 aa  122  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.89 
 
 		 586 aa  122  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.26 
 
 		 944 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  26.71 
 
 		 948 aa  121  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.81 
 
 		 947 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.16 
 
 		 1284 aa  119  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  26.74 
 
 		 948 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.88 
 
 		 1052 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.99 
 
 		 573 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  27.02 
 
 		 944 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  27.18 
 
 		 944 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.77 
 
 		 942 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  26.87 
 
 		 944 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  26.95 
 
 		 944 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.71 
 
 		 1075 aa  111  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.04 
 
 		 945 aa  109  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  26.27 
 
 		 2775 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  25.6 
 
 		 948 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3281  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.79 
 
 		 1123 aa  109  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.79 
 
 		 885 aa  106  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  27.92 
 
 		 2667 aa  104  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.84 
 
 		 955 aa  104  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  24.53 
 
 		 871 aa  103  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.47 
 
 		 826 aa  103  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.65 
 
 		 940 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  25.88 
 
 		 1310 aa  101  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.61 
 
 		 870 aa  99.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.95 
 
 		 870 aa  99.4  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.84 
 
 		 1641 aa  99  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.22 
 
 		 1525 aa  97.8  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.33 
 
 		 1091 aa  97.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.89 
 
 		 641 aa  96.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.61 
 
 		 892 aa  96.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.52 
 
 		 871 aa  96.3  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.02 
 
 		 870 aa  95.9  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.02 
 
 		 870 aa  95.5  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.71 
 
 		 876 aa  94  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  24.49 
 
 		 945 aa  93.6  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.88 
 
 		 870 aa  94  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  25.66 
 
 		 1503 aa  92  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  23.74 
 
 		 865 aa  91.7  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 870 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 870 aa  90.9  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.34 
 
 		 870 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.79 
 
 		 894 aa  90.9  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.99 
 
 		 1092 aa  89  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.05 
 
 		 2346 aa  87.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  26.07 
 
 		 2796 aa  87.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  27.01 
 
 		 863 aa  87  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.27 
 
 		 873 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.92 
 
 		 1641 aa  86.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  22.97 
 
 		 869 aa  85.1  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  28.75 
 
 		 1652 aa  82.8  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.01 
 
 		 929 aa  82.8  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  25.75 
 
 		 902 aa  81.3  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  23.45 
 
 		 572 aa  77.4  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  27.15 
 
 		 1577 aa  77  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.89 
 
 		 653 aa  76.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  24.24 
 
 		 1512 aa  71.6  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  23.7 
 
 		 984 aa  70.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>