More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0962 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  100 
 
 		 451 aa  903    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  59.68 
 
 		 443 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  56.43 
 
 		 449 aa  525  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  55.98 
 
 		 446 aa  511  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  53.15 
 
 		 443 aa  495  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  54.63 
 
 		 452 aa  491  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  55.08 
 
 		 451 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  54.85 
 
 		 451 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  45.66 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  44.91 
 
 		 448 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  45.54 
 
 		 450 aa  342  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  42.6 
 
 		 448 aa  340  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  45.52 
 
 		 445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  44.57 
 
 		 464 aa  325  7e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  44.17 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  42.2 
 
 		 452 aa  323  5e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  41.72 
 
 		 432 aa  322  7e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  43.27 
 
 		 452 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  41.33 
 
 		 457 aa  319  7.999999999999999e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  38.96 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  37.03 
 
 		 456 aa  313  5.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  41.24 
 
 		 448 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  39.12 
 
 		 453 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  41.24 
 
 		 448 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  40.39 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  40.39 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  40.15 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  40.72 
 
 		 438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  39.6 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  40.49 
 
 		 448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  34.51 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  39.56 
 
 		 452 aa  300  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  34.64 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  39.25 
 
 		 444 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  36.53 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  34.67 
 
 		 452 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  38.89 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  34.83 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  37.5 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  33.93 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  39.55 
 
 		 449 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  32.59 
 
 		 440 aa  276  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  35.29 
 
 		 444 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  35.7 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  34.86 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  34.86 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  34.86 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  34.86 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  40.59 
 
 		 453 aa  269  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  32.89 
 
 		 435 aa  268  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  35.15 
 
 		 444 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  34.95 
 
 		 444 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  35.16 
 
 		 444 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  35.29 
 
 		 444 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  37.2 
 
 		 451 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  34.3 
 
 		 444 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  38 
 
 		 471 aa  258  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  38.82 
 
 		 452 aa  256  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  30.65 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  38.74 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  36.14 
 
 		 445 aa  254  3e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  35.03 
 
 		 449 aa  254  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.65 
 
 		 442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  37.64 
 
 		 451 aa  253  7e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  32.37 
 
 		 435 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  32.37 
 
 		 435 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  38.88 
 
 		 436 aa  247  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  38.26 
 
 		 429 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  38.26 
 
 		 429 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  38.03 
 
 		 435 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  32.71 
 
 		 430 aa  244  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  36.39 
 
 		 440 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  35.63 
 
 		 447 aa  242  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  39.65 
 
 		 501 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  40.58 
 
 		 431 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  37.23 
 
 		 427 aa  242  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  39.56 
 
 		 429 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  39.56 
 
 		 429 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  36.74 
 
 		 427 aa  239  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  42.2 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  38.73 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  39.31 
 
 		 429 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  39.31 
 
 		 429 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  39.07 
 
 		 429 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  39.16 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  39.16 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  38.92 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  38.92 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  39.16 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  39.16 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  39.16 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  33.33 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  39.41 
 
 		 429 aa  234  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  37.81 
 
 		 431 aa  233  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  38.92 
 
 		 429 aa  233  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  38.92 
 
 		 429 aa  232  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  35.75 
 
 		 439 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.26 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  41.59 
 
 		 419 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.18 
 
 		 424 aa  229  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>