60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0952 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  538  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  44.03 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  28.04 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  29.44 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  27.86 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  27.84 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  22.49 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  26.59 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  20.82 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  26.32 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  24.44 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  23.51 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 1052 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  24.01 
 
 		 312 aa  58.5  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  23.36 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.19 
 
 		 1019 aa  56.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  24.45 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  25 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  21.48 
 
 		 781 aa  54.7  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  25.9 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  27.2 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  23.24 
 
 		 786 aa  54.3  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  26.24 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  23.62 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  21.82 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  20.85 
 
 		 780 aa  53.5  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  25.89 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  25.45 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  25.37 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  24.81 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  24.16 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  25.87 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  25.94 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  23.08 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  31.25 
 
 		 298 aa  49.3  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  22.46 
 
 		 1048 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  24.31 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  22.14 
 
 		 1124 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  22.44 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  23.97 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0258  hypothetical protein  30.77 
 
 		 324 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0340  UvrD/REP helicase  21.4 
 
 		 951 aa  46.2  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  22.93 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  26.67 
 
 		 313 aa  46.2  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  22.93 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  22.93 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  28.26 
 
 		 1038 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  25 
 
 		 351 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  24.53 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  23.24 
 
 		 202 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  27.59 
 
 		 1095 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  25.28 
 
 		 1076 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  20.22 
 
 		 1041 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2154  hypothetical protein  31.62 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.380971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0203  hypothetical protein  30 
 
 		 324 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  22.62 
 
 		 323 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  22.22 
 
 		 783 aa  42.7  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  26.14 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  23.7 
 
 		 1134 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 1060 aa  42.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>