More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0942 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3590  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.22 
 
 		 631 aa  734    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  80.45 
 
 		 628 aa  1020    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  70.64 
 
 		 637 aa  927    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  80.45 
 
 		 628 aa  1020    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.13 
 
 		 613 aa  673    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.74 
 
 		 616 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  72.33 
 
 		 640 aa  946    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  72.17 
 
 		 640 aa  944    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  59.35 
 
 		 613 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  56.75 
 
 		 619 aa  661    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  69.75 
 
 		 633 aa  821    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  82.35 
 
 		 628 aa  1059    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.49 
 
 		 631 aa  823    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  72.77 
 
 		 642 aa  902    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  57.65 
 
 		 617 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  56.62 
 
 		 616 aa  635    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  74.72 
 
 		 639 aa  954    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  57.33 
 
 		 617 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  70.96 
 
 		 637 aa  941    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  58.87 
 
 		 613 aa  692    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  100 
 
 		 630 aa  1268    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  63.34 
 
 		 632 aa  705    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  73.27 
 
 		 638 aa  922    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  58.51 
 
 		 602 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  57 
 
 		 617 aa  674    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.74 
 
 		 616 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  73.02 
 
 		 637 aa  957    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  80.03 
 
 		 628 aa  1040    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  80.92 
 
 		 628 aa  1038    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.84 
 
 		 640 aa  774    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  70.49 
 
 		 637 aa  934    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.46 
 
 		 616 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  61.96 
 
 		 667 aa  716    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  58.87 
 
 		 613 aa  673    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  82.99 
 
 		 628 aa  1072    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.84 
 
 		 640 aa  774    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  70.64 
 
 		 637 aa  936    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  61.39 
 
 		 615 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.9 
 
 		 612 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29118  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  64.66 
 
 		 632 aa  748    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  81.55 
 
 		 632 aa  1051    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.12 
 
 		 655 aa  784    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  56.78 
 
 		 617 aa  633  1e-180  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  55.85 
 
 		 615 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  55.85 
 
 		 615 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 		 630 aa  599  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.49 
 
 		 615 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.8 
 
 		 602 aa  594  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14591  cell division protein FtsH4  55.17 
 
 		 619 aa  592  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.584936 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  49.44 
 
 		 608 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.15 
 
 		 639 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.03 
 
 		 638 aa  579  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.89 
 
 		 621 aa  580  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.14 
 
 		 640 aa  578  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  54.39 
 
 		 651 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  49.84 
 
 		 614 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  51.31 
 
 		 616 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.1 
 
 		 611 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53 
 
 		 630 aa  568  1e-161  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.11 
 
 		 651 aa  569  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  56.53 
 
 		 627 aa  570  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.01 
 
 		 656 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.55 
 
 		 657 aa  565  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.61 
 
 		 632 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.08 
 
 		 620 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.46 
 
 		 643 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.32 
 
 		 652 aa  564  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.02 
 
 		 610 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  58.46 
 
 		 633 aa  559  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  58.87 
 
 		 633 aa  561  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  58.87 
 
 		 633 aa  561  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  58.87 
 
 		 633 aa  561  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  58.87 
 
 		 633 aa  561  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.42 
 
 		 639 aa  561  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.56 
 
 		 610 aa  560  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  52.5 
 
 		 693 aa  560  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  58.87 
 
 		 633 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  58.87 
 
 		 633 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  58.46 
 
 		 633 aa  556  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.86 
 
 		 635 aa  558  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.44 
 
 		 651 aa  557  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  58.46 
 
 		 633 aa  556  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.96 
 
 		 647 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17504  predicted protein  51.67 
 
 		 673 aa  558  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.91 
 
 		 607 aa  553  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.25 
 
 		 633 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  47.7 
 
 		 612 aa  552  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  49.17 
 
 		 659 aa  552  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  49.44 
 
 		 650 aa  552  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.12 
 
 		 640 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.99 
 
 		 612 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.79 
 
 		 608 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.61 
 
 		 655 aa  551  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  60.38 
 
 		 599 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.72 
 
 		 598 aa  551  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.358408  normal  0.0936427 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.39 
 
 		 619 aa  549  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.02 
 
 		 617 aa  549  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.99 
 
 		 612 aa  550  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.92 
 
 		 640 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 		 643 aa  550  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>