127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0897 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0897  cell division topological specificity factor MinE  100 
 
 
91 aa  181  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0560402  hitchhiker  0.00587681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1258  cell division topological specificity factor MinE  63.95 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0812089  normal  0.744102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1994  cell division topological specificity factor MinE  60.44 
 
 
100 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.829432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3479  cell division topological specificity factor MinE  60.92 
 
 
97 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0837361  normal  0.579917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3384  cell division topological specificity factor MinE  61.63 
 
 
95 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1316  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21901  cell division topological specificity factor MinE  62.2 
 
 
126 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.892996 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2769  cell division topological specificity factor MinE  62.07 
 
 
96 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.296613  normal  0.0661713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3348  cell division topological specificity factor MinE  62.07 
 
 
96 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1854  cell division topological specificity factor MinE  65 
 
 
95 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0713629  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0480  cell division topological specificity factor MinE  60.67 
 
 
102 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.689847  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3018  cell division topological specificity factor MinE  57.47 
 
 
97 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03561  cell division topological specificity factor MinE  60.24 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.217865  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04121  cell division topological specificity factor MinE  59.04 
 
 
115 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0552098  normal  0.388875 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1697  cell division topological specificity factor MinE  59.04 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.743987  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0326  cell division topological specificity factor MinE  55.81 
 
 
111 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03461  cell division topological specificity factor MinE  56.47 
 
 
111 aa  94.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03521  cell division topological specificity factor MinE  54.65 
 
 
105 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1460  cell division topological specificity factor MinE  51.16 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.799074  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03441  cell division topological specificity factor MinE  53.49 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61963  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1533  cell division topological specificity factor MinE  44.32 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.183546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2542  cell division topological specificity factor MinE  42.53 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.958579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2557  cell division topological specificity factor MinE  44.09 
 
 
94 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000283914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3333  cell division topological specificity factor MinE  39.77 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0369939  normal  0.713516 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1635  septum site-determining protein  45.45 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0732475  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1204  cell division topological specificity factor MinE  41.38 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0543  cell division topological specificity factor MinE  48.1 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000190425  normal  0.758266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0094  cell division topological specificity factor MinE  41.94 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000217477  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4345  cell division topological specificity factor MinE  36.9 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2128  cell division topological specificity factor MinE  39.08 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000173264  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0521  cell division topological specificity factor MinE  43.24 
 
 
79 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.617236  hitchhiker  0.000386475 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2369  cell division topological specificity factor MinE  39.02 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0155059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1307  cell division topological specificity factor MinE  43.59 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000125469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1282  cell division topological specificity factor MinE  40.24 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0546704  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2104  cell division topological specificity factor MinE  38.1 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000684529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2392  cell division topological specificity factor MinE  38.1 
 
 
90 aa  67  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000829737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14180  cell division topological specificity factor MinE  36.23 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.96332e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0933  cell division topological specificity factor MinE  42.47 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.533216 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1553  cell division topological specificity factor MinE  39.19 
 
 
74 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.326791  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1398  cell division topological specificity factor MinE  29.49 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000955334  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3408  cell division topological specificity factor MinE  35 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.350756  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3423  cell division topological specificity factor MinE  39.51 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00102224  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1557  cell division topological specificity factor MinE  32.5 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1352  cell division topological specificity factor MinE  30.99 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0345  septum site-determining protein  35.8 
 
 
81 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1166  cell division topological specificity factor MinE  40.58 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000063438  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0377  cell division topological specificity factor MinE  45.61 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0506  septum formation topological specificity factor MinE  32.88 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2112  cell division topological specificity factor MinE  33.75 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181978  normal  0.32779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3785  cell division topological specificity factor MinE  37.65 
 
 
91 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0873696  normal  0.0155395 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1589  cell division topological specificity factor MinE  35.71 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.227403  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0323  cell division topological specificity factor MinE  31.76 
 
 
90 aa  50.1  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0226331  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0296  cell division topological specificity factor MinE  31.76 
 
 
90 aa  50.1  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00745796  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28147  predicted protein  29.63 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908244  decreased coverage  0.00612417 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4342  cell division topological specificity factor MinE  32.88 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.302634 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1282  cell division topological specificity factor MinE  33.75 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120256  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0321  cell division topological specificity factor MinE  31.51 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.332836  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4711  cell division topological specificity factor MinE  35.71 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274995  decreased coverage  0.00834487 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5652  cell division topological specificity factor MinE  32.35 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375925  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1732  cell division topological specificity factor MinE  32.5 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.656764  normal  0.252053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2186  cell division topological specificity factor MinE  32.86 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000316075  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1233  cell division topological specificity factor MinE  30 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236843  normal  0.296312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0967  cell division topological specificity factor MinE  39.13 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3987  cell division topological specificity factor MinE  32.5 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1324  cell division topological specificity factor MinE  32.5 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6588  cell division topological specificity factor MinE  30.88 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.898114  hitchhiker  0.00722875 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0869  cell division topological specificity factor MinE  30.99 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2521  cell division topological specificity factor MinE  34.92 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000024687  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1219  cell division topological specificity factor MinE  30.23 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.594254 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0012  cell division topological specificity factor MinE  36.36 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0291332 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0011  cell division topological specificity factor MinE  36.36 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2034  cell division topological specificity factor MinE  32.43 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22010  cell division topological specificity factor MinE  31.88 
 
 
84 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.609699  hitchhiker  0.0000000000271778 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1547  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 
87 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000749363  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3506  cell division topological specificity factor MinE  32.05 
 
 
86 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0458207  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1880  cell division topological specificity factor MinE  31.88 
 
 
84 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35130  cell division topological specificity factor MinE  31.71 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45463  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1611  cell division topological specificity factor MinE  28.75 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3025  cell division topological specificity factor MinE  31.25 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129756  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0065  cell division topological specificity factor MinE  29.21 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004088  cell division topological specificity factor MinE  30.77 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000145291  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1269  cell division topological specificity factor MinE  29.58 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.193972  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0551  cell division topological specificity factor MinE  26.32 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1430  cell division topological specificity factor MinE  29.58 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.642558  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1627  cell division topological specificity factor MinE  34.78 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000660845  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2373  cell division topological specificity factor MinE  31.25 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116019  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2234  cell division topological specificity factor MinE  32.5 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000201972  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1955  cell division topological specificity factor MinE  31.25 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00065968  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2015  cell division topological specificity factor MinE  31.25 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00111528  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1958  cell division topological specificity factor MinE  31.25 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000738777  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1317  cell division topological specificity factor MinE  31.25 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000676449  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1501  cell division topological specificity factor MinE  31.25 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00311098  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3874  cell division topological specificity factor MinE  28.75 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0810055  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2304  cell division topological specificity factor MinE  26.39 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1932  cell division topological specificity factor MinE  31.94 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000555789  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01383  cell division topological specificity factor MinE  30.77 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0927  cell division topological specificity factor MinE  30 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2474  cell division topological specificity factor MinE  31.25 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00314512  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2008  cell division topological specificity factor MinE  31.25 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1735  cell division topological specificity factor MinE  34.43 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1274  cell division topological specificity factor MinE  31.25 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000236867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>