135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0892 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  100 
 
 		 336 aa  684    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  63.67 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  63.02 
 
 		 340 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  64.26 
 
 		 307 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  60.32 
 
 		 318 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  60 
 
 		 318 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  57.56 
 
 		 319 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  61.95 
 
 		 325 aa  352  7e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  40.32 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  46.15 
 
 		 326 aa  206  7e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  41.03 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 390 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  38.71 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  40.82 
 
 		 565 aa  192  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  38.3 
 
 		 331 aa  188  9e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  40.74 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  39.24 
 
 		 826 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  39.67 
 
 		 387 aa  176  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  34.38 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  37.78 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  36.1 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  35.17 
 
 		 392 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  38.61 
 
 		 389 aa  172  6.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  35.99 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  38.93 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  34.8 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  37.13 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  35.83 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  34.7 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.72 
 
 		 737 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  37.03 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  36.45 
 
 		 792 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  35.4 
 
 		 800 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  35.36 
 
 		 856 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  34.99 
 
 		 859 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  34.99 
 
 		 859 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  34.99 
 
 		 859 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  34.63 
 
 		 859 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.32 
 
 		 741 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  36.11 
 
 		 380 aa  159  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.02 
 
 		 863 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  34.12 
 
 		 859 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  36.88 
 
 		 386 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  34.49 
 
 		 842 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  35.55 
 
 		 841 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  35.71 
 
 		 820 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  36.6 
 
 		 944 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  33.73 
 
 		 838 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  35.98 
 
 		 841 aa  151  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  35 
 
 		 416 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.22 
 
 		 737 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  33.24 
 
 		 875 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  34.91 
 
 		 881 aa  149  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  35.44 
 
 		 860 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  35.43 
 
 		 836 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  36.89 
 
 		 899 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  35.65 
 
 		 852 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  33.81 
 
 		 872 aa  145  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 430 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  35.21 
 
 		 884 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 		 757 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  35.93 
 
 		 811 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  36.14 
 
 		 779 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  34.38 
 
 		 871 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  32.51 
 
 		 859 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  32.74 
 
 		 867 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  33.33 
 
 		 857 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.58 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  23.51 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  25.27 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  23.73 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  27.05 
 
 		 355 aa  53.1  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 347 aa  52.8  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  23.6 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  22.81 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  24.57 
 
 		 364 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  28.92 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  25.09 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  22.76 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  22.15 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  26.41 
 
 		 515 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.68 
 
 		 367 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.04 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  22.39 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2097  biotin synthase  25.79 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.178229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.4 
 
 		 378 aa  49.7  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  24.06 
 
 		 391 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  25.6 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.28 
 
 		 464 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  26.27 
 
 		 374 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  23.97 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 		 404 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>