More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0785 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 
712 aa  1425  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  55.59 
 
 
776 aa  637  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  54.08 
 
 
755 aa  627  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  54.93 
 
 
811 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  52.18 
 
 
626 aa  607  1e-172  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  55.46 
 
 
658 aa  607  1e-172  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  54.28 
 
 
824 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  54.45 
 
 
824 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  53.37 
 
 
680 aa  595  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  52.14 
 
 
692 aa  570  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  50.35 
 
 
602 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  43.94 
 
 
643 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  43.09 
 
 
618 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  44.79 
 
 
643 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  44.79 
 
 
643 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  42.65 
 
 
734 aa  416  1e-115  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  43.57 
 
 
640 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2000  penicillin-binding protein 1A  44.46 
 
 
740 aa  415  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  42.66 
 
 
732 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  41.52 
 
 
739 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  43.06 
 
 
714 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  42.05 
 
 
734 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  41.78 
 
 
727 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  42.05 
 
 
727 aa  407  1e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  41.81 
 
 
728 aa  408  1e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  43.42 
 
 
714 aa  408  1e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  40.33 
 
 
806 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  41.89 
 
 
720 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  42.49 
 
 
640 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  41.24 
 
 
654 aa  402  1e-110  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  41.45 
 
 
728 aa  400  1e-110  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  40.85 
 
 
768 aa  401  1e-110  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  39.96 
 
 
648 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1945  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  41.59 
 
 
751 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  40.6 
 
 
779 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  43.24 
 
 
761 aa  399  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  40.31 
 
 
759 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  42.94 
 
 
750 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  41.59 
 
 
751 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  42.96 
 
 
709 aa  396  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  41.24 
 
 
720 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  41.55 
 
 
770 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  42.83 
 
 
691 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  40.25 
 
 
776 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  40.28 
 
 
735 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  44.61 
 
 
751 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  40.53 
 
 
741 aa  392  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  39.72 
 
 
759 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  41.01 
 
 
727 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  40.43 
 
 
775 aa  389  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.21042e-11 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  40.59 
 
 
757 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  40.19 
 
 
769 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  44.28 
 
 
625 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  40.21 
 
 
833 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  39.62 
 
 
757 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  40.73 
 
 
651 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  38.23 
 
 
714 aa  385  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0021  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  42.35 
 
 
762 aa  386  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61335  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  40.03 
 
 
712 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  40.25 
 
 
760 aa  385  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  41.23 
 
 
661 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  40.19 
 
 
750 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  39.48 
 
 
784 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  41.23 
 
 
723 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  38.94 
 
 
750 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  41.89 
 
 
709 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  39.66 
 
 
760 aa  382  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  39.48 
 
 
765 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  39.44 
 
 
646 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.46416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  38.8 
 
 
758 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  40 
 
 
761 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  40.83 
 
 
730 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  37.39 
 
 
724 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  39.25 
 
 
667 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.45418e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  38.24 
 
 
718 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  38.24 
 
 
724 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  40.83 
 
 
763 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  40.94 
 
 
765 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  38.86 
 
 
905 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  41.43 
 
 
710 aa  372  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  38.88 
 
 
727 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  40.83 
 
 
679 aa  369  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  40.58 
 
 
732 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  39.57 
 
 
648 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  39.25 
 
 
744 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0426  putative penicillin binding protein  36.4 
 
 
589 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  42.34 
 
 
656 aa  368  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  39.07 
 
 
693 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.43648e-11  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  39.29 
 
 
683 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04821  putative penicillin binding protein  37.34 
 
 
589 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.725323  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  39.32 
 
 
656 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  38.06 
 
 
662 aa  365  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  39.89 
 
 
751 aa  363  4e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  39.44 
 
 
718 aa  364  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  41.07 
 
 
796 aa  362  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2473  glycosyl transferase/transpeptidase  41.01 
 
 
756 aa  362  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  38.21 
 
 
707 aa  361  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  40.24 
 
 
681 aa  361  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  38.11 
 
 
683 aa  361  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  37.29 
 
 
707 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>