19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0758 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0758  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  292  8e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.223342  normal  0.212475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3344  protein of unknown function DUF1130  55.81 
 
 
139 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  28.87 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  28.03 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4723  protein of unknown function DUF1130  30.07 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264076  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0922  hypothetical protein  28.57 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  25.19 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3408  hypothetical protein  30.88 
 
 
307 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  27.27 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0017  hypothetical protein  29.05 
 
 
177 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0626  protein of unknown function DUF1130  27.27 
 
 
194 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  26.24 
 
 
224 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  28.36 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  25.37 
 
 
185 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  25.81 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  24.67 
 
 
186 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  25.35 
 
 
177 aa  40.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  26.67 
 
 
195 aa  40.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  26.57 
 
 
198 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.98733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>