More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0712 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  100 
 
 
425 aa  863    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  65.4 
 
 
430 aa  571  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  65.17 
 
 
430 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  61.67 
 
 
429 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  61.68 
 
 
430 aa  546  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  60.1 
 
 
428 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  63.01 
 
 
426 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  59.67 
 
 
427 aa  524  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  59.08 
 
 
449 aa  468  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  58.96 
 
 
444 aa  457  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  58.53 
 
 
453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  55.73 
 
 
450 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  51.29 
 
 
434 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  51.79 
 
 
434 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  53.38 
 
 
444 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  52.74 
 
 
444 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  52.64 
 
 
444 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  52.55 
 
 
433 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  52.06 
 
 
447 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  51.72 
 
 
431 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  50.49 
 
 
446 aa  398  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  48.66 
 
 
434 aa  391  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  51.3 
 
 
440 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  47.18 
 
 
413 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  48.22 
 
 
434 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  46.43 
 
 
458 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  46.43 
 
 
458 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  49.87 
 
 
417 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  48.47 
 
 
413 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  48.47 
 
 
413 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  44.1 
 
 
440 aa  361  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  49.21 
 
 
412 aa  359  6e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  44.96 
 
 
407 aa  355  8.999999999999999e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  45.63 
 
 
416 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  47.03 
 
 
409 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  43.15 
 
 
410 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  37.56 
 
 
446 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  39.3 
 
 
394 aa  267  2e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  38.71 
 
 
429 aa  265  1e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  39.18 
 
 
436 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  39.19 
 
 
457 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  37.71 
 
 
427 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  38.9 
 
 
436 aa  259  7e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  43.07 
 
 
398 aa  259  8e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  37.89 
 
 
429 aa  255  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  40.71 
 
 
389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  40.52 
 
 
410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  40.24 
 
 
401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  37.14 
 
 
431 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  37.14 
 
 
428 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  40.69 
 
 
455 aa  249  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  42.86 
 
 
400 aa  249  8e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  39.64 
 
 
443 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  40.87 
 
 
418 aa  248  1e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  40.11 
 
 
444 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  38.15 
 
 
452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  40.47 
 
 
440 aa  246  8e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  40.05 
 
 
438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  44.76 
 
 
461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  40 
 
 
444 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  41.59 
 
 
379 aa  243  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  41.72 
 
 
389 aa  242  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  39.49 
 
 
439 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  41.83 
 
 
429 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  35.03 
 
 
418 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  41.99 
 
 
440 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  40.37 
 
 
426 aa  241  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  42.3 
 
 
440 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  45.28 
 
 
439 aa  240  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37419  D1 proceesing peptidase  40.68 
 
 
446 aa  240  4e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  44.62 
 
 
441 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  40.63 
 
 
458 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  40.35 
 
 
456 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  42.09 
 
 
439 aa  239  6.999999999999999e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  42.15 
 
 
433 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  41.32 
 
 
383 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  37.84 
 
 
443 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  42.51 
 
 
457 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  42.05 
 
 
428 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 
402 aa  237  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  43.21 
 
 
453 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  42.33 
 
 
451 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  38.93 
 
 
446 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 
402 aa  237  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  39.31 
 
 
423 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  41.27 
 
 
440 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  41.79 
 
 
440 aa  236  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  41.79 
 
 
440 aa  236  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  43.17 
 
 
455 aa  236  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  43.07 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  41.57 
 
 
428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  39.6 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  39.27 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  37.16 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  41.92 
 
 
446 aa  233  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  38.34 
 
 
429 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46670  predicted protein  37.43 
 
 
476 aa  233  4.0000000000000004e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  38.75 
 
 
444 aa  233  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  36.32 
 
 
423 aa  233  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  38.27 
 
 
428 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>