More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0701 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0701  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  307  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00299166  normal  0.252492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3139  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  58.82 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0641  thioesterase superfamily protein  56.82 
 
 
165 aa  162  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4502  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  54.89 
 
 
161 aa  157  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4077  thioesterase superfamily protein  53.73 
 
 
143 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  47.62 
 
 
162 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1149  thioesterase superfamily protein  46.94 
 
 
163 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1179  thioesterase superfamily protein  46.94 
 
 
163 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1860  hypothetical protein  41.84 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22071  hypothetical protein  46.56 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03521  thioesterase  37.69 
 
 
148 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0474  hypothetical protein  42.75 
 
 
134 aa  102  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.637818  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1023  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  29.92 
 
 
139 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00412471  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11021  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  29.13 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0792873  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10971  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  29.13 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.984698  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11031  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  28.35 
 
 
139 aa  91.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.212306  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04081  thioesterase  31.54 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.764654 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1694  thioesterase  30.77 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  28.71 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.71 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.71 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  25 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.71 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.71 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.71 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.71 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.71 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.16 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  26.47 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  27.73 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  27.73 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0148  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  28.95 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  29.9 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  25.44 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1366  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  27.72 
 
 
137 aa  60.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2196  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0787  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.08 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267485  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  30.6 
 
 
138 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.25 
 
 
145 aa  59.7  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  28.45 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  28.45 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  30.21 
 
 
138 aa  58.2  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0434  thioesterase superfamily protein  23.31 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  21.85 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  39.73 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  26.47 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  27.78 
 
 
149 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.95 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0104  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0454736  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  28.33 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.1 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.19 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.1 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  28.46 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  31.51 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  31.51 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  31.51 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0418657 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  31.51 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
144 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  36.21 
 
 
152 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.27 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  29.09 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.09 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.09 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.86 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  29.09 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.09 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.09 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.15 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.09 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.09 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  34.18 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0807  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.09 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000852325  normal  0.479233 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2872  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.83 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000275881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0840  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.09 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  0.646292 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.83 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>