76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0697 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_04051  photosystem II PsbB protein (CP47)  71.74 
 
 		 507 aa  758    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.644071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4113  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  85.71 
 
 		 509 aa  877    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3051  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  84.45 
 
 		 508 aa  873    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000997071  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0861  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  81.93 
 
 		 510 aa  857    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000036456  decreased coverage  0.00000114007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1572  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  85.24 
 
 		 508 aa  881    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3069  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  84.45 
 
 		 508 aa  873    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03501  photosystem II PsbB protein (CP47)  69.25 
 
 		 518 aa  738    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03401  photosystem II PsbB protein (CP47)  73.47 
 
 		 507 aa  796    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22121  photosystem II PsbB protein (CP47)  74.51 
 
 		 510 aa  799    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03471  photosystem II PsbB protein (CP47)  74.06 
 
 		 507 aa  801    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03391  photosystem II PsbB protein (CP47)  73.07 
 
 		 507 aa  795    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0452672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4666  photosystem antenna protein-like  81.98 
 
 		 508 aa  847    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0622483  normal  0.0120025 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0697  photosystem II core light harvesting protein  100 
 
 		 508 aa  1028    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000016119  normal  0.0946335 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0321  photosystem II PsbB protein (CP47)  73.66 
 
 		 507 aa  799    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0470  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  79.41 
 
 		 519 aa  830    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1692  photosystem II PsbB protein (CP47)  71.74 
 
 		 507 aa  758    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1864  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  80 
 
 		 519 aa  837    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1507  photosystem antenna protein-like  85.52 
 
 		 509 aa  879    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000124352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16081  photosystem II PsbC protein (CP43)  27.99 
 
 		 460 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.548682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0768  photosystem II PsbC protein (CP43)  27.99 
 
 		 460 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13501  photosystem II PsbC protein (CP43)  26.48 
 
 		 460 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.151398  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13251  photosystem II PsbC protein (CP43)  26.48 
 
 		 460 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  unclonable  0.000121028  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0513  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  24.85 
 
 		 459 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13351  photosystem II PsbC protein (CP43)  26.48 
 
 		 460 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1257  photosystem II PsbC protein (CP43)  27.36 
 
 		 460 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0172037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2485  photosystem antenna protein-like  30.37 
 
 		 522 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0578  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  23.78 
 
 		 459 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0053  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  24.35 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000498494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0055  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  24.35 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0656  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  27.7 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12341  photosystem II PsbC protein (CP43)  27.8 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.606702  normal  0.098859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0217  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  25.61 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0294116  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2484  photosystem antenna protein-like  28.37 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.965644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1060  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  23.67 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000366993  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1243  photosynthetic II protein PsbC  22.9 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1993  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  27.46 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.296438  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08471  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  25.79 
 
 		 352 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.679252  hitchhiker  0.00174435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2483  photosystem antenna protein-like  26.62 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08421  photosystem II PsbC protein (CP43)  25.33 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0215  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  25.32 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1795  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  28.47 
 
 		 359 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09521  hypothetical protein  25.61 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722234 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1590  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  26.67 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10047  hitchhiker  0.00277314 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0667  photosynthetic II protein PsbC  26.78 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.329399  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07351  light-harvesting complex protein  26.6 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.112937 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0627  light-harvesting complex protein  27.05 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06881  light-harvesting complex protein  26.24 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0066  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbA  26.24 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14531  hypothetical protein  27.05 
 
 		 355 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358475 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15551  hypothetical protein  27.33 
 
 		 370 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.203138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0718  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbC  27.33 
 
 		 370 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1271  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  26.02 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0702178  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13631  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  25.47 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1667  photosystem antenna protein-like  26.28 
 
 		 344 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00889751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06831  light-harvesting complex protein  25.27 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11631  hypothetical protein  27.6 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0312993 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13721  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  25.16 
 
 		 352 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13421  hypothetical protein  25.47 
 
 		 352 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.233914  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06541  light-harvesting complex protein  25.27 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1005  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  24.82 
 
 		 359 aa  55.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0723  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  26.69 
 
 		 354 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.543048  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06931  light-harvesting complex protein  26.15 
 
 		 352 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15611  hypothetical protein  26.69 
 
 		 354 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.732375  normal  0.917864 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17721  light-harvesting complex protein  32.28 
 
 		 368 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15601  hypothetical protein  23.91 
 
 		 362 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.963648 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0722  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbE  23.91 
 
 		 362 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.683508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2434  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  27.37 
 
 		 342 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000346716  hitchhiker  0.0000000117955 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14281  hypothetical protein  31.86 
 
 		 365 aa  50.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517015 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1542  iron-stress chlorophyll-binding protein  27.11 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398653  normal  0.0103257 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0717  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbH  22.96 
 
 		 351 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15541  hypothetical protein  22.96 
 
 		 351 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10131  light-harvesting complex protein  40 
 
 		 350 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0719  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  29.11 
 
 		 349 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.17492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15561  hypothetical protein  29.11 
 
 		 349 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.95378 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11601  hypothetical protein  30.37 
 
 		 349 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0985613 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11571  hypothetical protein  31.73 
 
 		 361 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0991489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>