230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0686 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  100 
 
 		 386 aa  786    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  63.4 
 
 		 391 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  62.17 
 
 		 382 aa  495  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  60.81 
 
 		 376 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  61.25 
 
 		 384 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  60.98 
 
 		 384 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  64.36 
 
 		 381 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  65.88 
 
 		 398 aa  482  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  44.78 
 
 		 358 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  40.84 
 
 		 800 aa  278  9e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  43.36 
 
 		 376 aa  276  6e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  46.2 
 
 		 857 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  39.88 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  48.07 
 
 		 872 aa  273  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  44.32 
 
 		 841 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.51 
 
 		 453 aa  272  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  42.22 
 
 		 859 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  43.55 
 
 		 842 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  42.22 
 
 		 859 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  41.22 
 
 		 418 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  41.95 
 
 		 859 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  42.74 
 
 		 841 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  44.8 
 
 		 820 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  42.22 
 
 		 859 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  41.76 
 
 		 359 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  44.44 
 
 		 779 aa  267  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  46.78 
 
 		 884 aa  266  5e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  44.06 
 
 		 944 aa  266  7e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.99 
 
 		 875 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  43.36 
 
 		 856 aa  262  8e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  41.24 
 
 		 792 aa  262  8.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  43.7 
 
 		 859 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  39.52 
 
 		 435 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  40.29 
 
 		 359 aa  259  7e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  40.59 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  42.09 
 
 		 899 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  42.62 
 
 		 836 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.07 
 
 		 863 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  41.35 
 
 		 871 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  43.19 
 
 		 859 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  43.11 
 
 		 860 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  37.5 
 
 		 359 aa  256  6e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  41.64 
 
 		 867 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  42.38 
 
 		 838 aa  252  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 419 aa  251  1e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  37.33 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  42.86 
 
 		 852 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  38.36 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  38.54 
 
 		 362 aa  249  6e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  39.76 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  38.62 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.74 
 
 		 741 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  40.83 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.48 
 
 		 737 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.01 
 
 		 737 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  37.93 
 
 		 366 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  39.62 
 
 		 367 aa  245  9e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  39.95 
 
 		 826 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  40.99 
 
 		 881 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  38.21 
 
 		 362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  42.98 
 
 		 757 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  36.46 
 
 		 360 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  36.73 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  38.06 
 
 		 362 aa  229  6e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  36.9 
 
 		 373 aa  227  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  36.6 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  36.44 
 
 		 356 aa  223  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  37.09 
 
 		 358 aa  223  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  38.01 
 
 		 358 aa  219  6e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  38.23 
 
 		 359 aa  219  7e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  35.73 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  33.69 
 
 		 361 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  34.04 
 
 		 360 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  34.69 
 
 		 364 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  37.28 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  35.92 
 
 		 358 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  36.78 
 
 		 365 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  39.64 
 
 		 358 aa  212  7e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  35.83 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  34.83 
 
 		 364 aa  209  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  36.97 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  34.96 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  35.2 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  38.5 
 
 		 373 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  37.35 
 
 		 373 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  35.92 
 
 		 355 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  37.21 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  35.31 
 
 		 367 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  35.49 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  35.86 
 
 		 364 aa  203  5e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  35.07 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  37.89 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  35.22 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 		 353 aa  201  3e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  33.78 
 
 		 361 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  32.55 
 
 		 364 aa  199  5e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  35.25 
 
 		 380 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  36.22 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  34.15 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  36.42 
 
 		 348 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>