248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0616 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 		 353 aa  692    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  55.15 
 
 		 364 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  51.4 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  48.9 
 
 		 370 aa  342  5e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  50.85 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  50.85 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.66 
 
 		 365 aa  333  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  53.59 
 
 		 365 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.85 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  32.39 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.2 
 
 		 343 aa  188  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.29 
 
 		 345 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.95 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26961  negative regulator of class I heat shock protein  38.33 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.25 
 
 		 348 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.56 
 
 		 347 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.9 
 
 		 345 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  29.6 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.36 
 
 		 344 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2097  negative regulator of class I heat shock protein  37.72 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.26 
 
 		 351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2417  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.23 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  31.04 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  29.89 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.58 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  30.45 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  30.75 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  30.75 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  30.75 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  30.45 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  30.45 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.9 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  30.45 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  30.45 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  32 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.1 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.13 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.41 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.43 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  31.53 
 
 		 342 aa  166  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  30.75 
 
 		 338 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 341 aa  166  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  33.61 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  33.61 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  33.61 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.01 
 
 		 339 aa  162  7e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.52 
 
 		 337 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.31 
 
 		 357 aa  162  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.77 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.05 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.39 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  33.61 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.77 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  32.11 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  27.35 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  27.35 
 
 		 339 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  33.81 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.03 
 
 		 343 aa  159  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.52 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  30.99 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  31.05 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.39 
 
 		 348 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  32.69 
 
 		 351 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.93 
 
 		 337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  30.31 
 
 		 349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.92 
 
 		 342 aa  156  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.79 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  30.79 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.79 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  31.65 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  31.83 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.6 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.86 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.49 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  30.48 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  29.39 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  30.2 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  32.88 
 
 		 340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  30.99 
 
 		 342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  30.97 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.46 
 
 		 355 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  30.97 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  30.9 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  33.8 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  30.17 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  30.9 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  32.29 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  32.87 
 
 		 343 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  31.09 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  30.11 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.96 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.86 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  32 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  32.42 
 
 		 354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>