More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0609 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0609  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
496 aa  965  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0349  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  60.45 
 
 
506 aa  558  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224429  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1375  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  60.41 
 
 
494 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4474  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  62.37 
 
 
500 aa  523  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220844  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1619  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  59.25 
 
 
494 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0249926  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1594  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  59.04 
 
 
494 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1099  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  55.28 
 
 
496 aa  515  1e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1867  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  62.26 
 
 
493 aa  516  1e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1620  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  65.36 
 
 
503 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4311  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  53.42 
 
 
523 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0412601  hitchhiker  0.0081583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4249  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  53.42 
 
 
523 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1606  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.64 
 
 
496 aa  475  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0748  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  54.36 
 
 
500 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00127358  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0760  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  56.88 
 
 
496 aa  467  1e-130  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.29344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4860  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.06 
 
 
513 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4080  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  53.5 
 
 
498 aa  461  1e-128  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2092  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.57 
 
 
513 aa  348  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1030  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  43.58 
 
 
511 aa  310  4e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2796  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  41 
 
 
537 aa  309  9e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10561  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  41.58 
 
 
523 aa  308  2e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2882  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  39.64 
 
 
534 aa  308  2e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139376  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.08 
 
 
507 aa  306  5e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06501  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  40.61 
 
 
524 aa  303  3e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0030  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  40.2 
 
 
524 aa  303  4e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2308  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  39.87 
 
 
561 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0836  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  42.27 
 
 
563 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0594  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  41.52 
 
 
512 aa  299  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.926621  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18571  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  41.01 
 
 
523 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.960985 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2049  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.12 
 
 
495 aa  298  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.16 
 
 
497 aa  298  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0931  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  41.8 
 
 
504 aa  298  2e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.743179  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  38.07 
 
 
510 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06591  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  41.76 
 
 
512 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  37.78 
 
 
514 aa  295  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1103  NADH dehydrogenase subunit M  38.72 
 
 
495 aa  294  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135594  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06501  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  41.67 
 
 
513 aa  294  3e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  36.34 
 
 
489 aa  294  3e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06201  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  41.67 
 
 
513 aa  293  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.14 
 
 
503 aa  293  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  38.82 
 
 
502 aa  292  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.55 
 
 
549 aa  292  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137682  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  39.95 
 
 
503 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  38.64 
 
 
502 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1886  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  39.09 
 
 
532 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.63526e-09 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1439  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  40.99 
 
 
533 aa  291  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1268  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.55 
 
 
549 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2401  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  39.15 
 
 
533 aa  291  3e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2580  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.55 
 
 
549 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233516  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  38.43 
 
 
502 aa  290  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  36.81 
 
 
512 aa  289  7e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1976  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  38.3 
 
 
534 aa  289  8e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.304394 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  38.4 
 
 
505 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1745  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  39.82 
 
 
525 aa  289  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.716507  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  36.63 
 
 
501 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0853  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.49 
 
 
545 aa  287  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1516  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  38.64 
 
 
538 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3241  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  43.22 
 
 
561 aa  288  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  39.72 
 
 
503 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.95 
 
 
507 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0986  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.73 
 
 
509 aa  287  3e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02221  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  38.43 
 
 
538 aa  287  3e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  38.53 
 
 
496 aa  287  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  38.43 
 
 
515 aa  286  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0659  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  39.22 
 
 
527 aa  286  6e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.79601  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  36.16 
 
 
513 aa  286  8e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4388  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  38.61 
 
 
526 aa  286  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1280  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.58 
 
 
554 aa  286  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4450  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  38.61 
 
 
526 aa  286  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.487224 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  38.53 
 
 
496 aa  285  1e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1415  NADH dehydrogenase (quinone)  38.94 
 
 
491 aa  285  1e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.508375  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  38.53 
 
 
496 aa  285  1e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  38.53 
 
 
496 aa  285  1e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  38.53 
 
 
496 aa  285  1e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  38.53 
 
 
496 aa  285  1e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0816  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.37 
 
 
497 aa  285  1e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0970  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.99 
 
 
545 aa  285  1e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0163848  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  38.53 
 
 
496 aa  285  1e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4656  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  41.89 
 
 
561 aa  285  1e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000336952 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1958  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.92 
 
 
501 aa  285  1e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0280811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  38.7 
 
 
506 aa  285  1e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  38.53 
 
 
496 aa  285  1e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  37.79 
 
 
502 aa  284  2e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.65 
 
 
495 aa  285  2e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  36.07 
 
 
522 aa  284  3e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  38.79 
 
 
503 aa  284  3e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.62 
 
 
525 aa  283  4e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0763  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.27 
 
 
492 aa  283  4e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  1.88631e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1059  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.03 
 
 
502 aa  283  4e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1540  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  37.34 
 
 
537 aa  283  5e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.3577 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1503  NADH dehydrogenase subunit M  39.29 
 
 
511 aa  283  6e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.03 
 
 
519 aa  283  7e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0152  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  38.23 
 
 
534 aa  283  7e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  37.2 
 
 
524 aa  282  8e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01299  NADH dehydrogenase subunit M  36.31 
 
 
491 aa  282  9e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648189  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01691  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  38.23 
 
 
531 aa  282  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588128  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.35 
 
 
503 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01671  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  38.23 
 
 
534 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1571  NADH dehydrogenase subunit M  38.89 
 
 
510 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1805  NADH dehydrogenase subunit M  38.89 
 
 
510 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.168858 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1465  NADH dehydrogenase subunit M  38.89 
 
 
510 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>