More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0579 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  100 
 
 
377 aa  769    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  74.01 
 
 
377 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  73.74 
 
 
377 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  74.53 
 
 
378 aa  570  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  72.15 
 
 
377 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  72.55 
 
 
376 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  70.73 
 
 
385 aa  549  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  67.37 
 
 
377 aa  549  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  67.8 
 
 
382 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  64.8 
 
 
377 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  64.27 
 
 
377 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  64.15 
 
 
373 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  66.49 
 
 
381 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  62.93 
 
 
377 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  63.35 
 
 
382 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  66.58 
 
 
381 aa  500  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  64.34 
 
 
382 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  64.34 
 
 
382 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  52.85 
 
 
385 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  51.47 
 
 
374 aa  335  5.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  50.41 
 
 
372 aa  323  3e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  44.84 
 
 
381 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  45.05 
 
 
387 aa  302  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  44.72 
 
 
377 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  43.96 
 
 
387 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  41.76 
 
 
507 aa  296  3e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  43.21 
 
 
381 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  38.13 
 
 
383 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43286  predicted protein  39.4 
 
 
456 aa  266  5e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  normal  0.0628635 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43238  predicted protein  39.4 
 
 
456 aa  266  5e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169779  normal  0.020707 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.17 
 
 
380 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.08 
 
 
380 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  37.08 
 
 
380 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  37.08 
 
 
380 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.81 
 
 
380 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.81 
 
 
380 aa  258  9e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.9 
 
 
380 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.17 
 
 
380 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  36.55 
 
 
380 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 
381 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
387 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  35.64 
 
 
381 aa  226  6e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  36.17 
 
 
420 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  37.07 
 
 
384 aa  225  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  38.01 
 
 
373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  35.17 
 
 
375 aa  212  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  37.96 
 
 
416 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
385 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  34.4 
 
 
375 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0755  glycosyl transferase, group 1  35.83 
 
 
375 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  34.84 
 
 
426 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
379 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
378 aa  204  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0761  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 
376 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  36.44 
 
 
403 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07870  glycosyltransferase  35.43 
 
 
391 aa  204  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0775  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 
376 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193821  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  36.03 
 
 
406 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  36.03 
 
 
406 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.29 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  32.89 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 
819 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.02 
 
 
396 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  35.2 
 
 
378 aa  197  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 
413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
405 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  36.02 
 
 
396 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 
406 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
381 aa  195  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  30.73 
 
 
376 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 
404 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  34.49 
 
 
434 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
390 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
385 aa  192  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  33.95 
 
 
373 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
396 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
427 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
432 aa  189  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1095  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
383 aa  189  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  30.87 
 
 
372 aa  189  9e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 
375 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 
398 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 
403 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2239  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
458 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  33.51 
 
 
405 aa  187  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  34.5 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
342 aa  184  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 
372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  36.15 
 
 
812 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 
400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  31.59 
 
 
344 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
378 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
344 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.16 
 
 
373 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
350 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 
354 aa  176  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>