93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0566 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0566  HAD family hydrolase  100 
 
 
251 aa  505  1e-142  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0688357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3590  HAD family hydrolase  48.98 
 
 
270 aa  234  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.684772  normal  0.0477257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3874  HAD family hydrolase  42.23 
 
 
260 aa  223  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0597322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0088  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  45.42 
 
 
265 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5151  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  48.54 
 
 
321 aa  220  1e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5196  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.73 
 
 
278 aa  129  5e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0610  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
282 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52168e-06 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4133  HAD family hydrolase  30.8 
 
 
271 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2053  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
287 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1091  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.57 
 
 
297 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.024164  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1184  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.68 
 
 
297 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24726  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2056  HAD family hydrolase  30.35 
 
 
268 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413042  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1263  hypothetical protein  30.94 
 
 
295 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151023  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2700  HAD family hydrolase  30.68 
 
 
270 aa  98.6  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0769  HAD family hydrolase  29.03 
 
 
257 aa  97.1  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0183682  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6760  HAD family hydrolase  30.47 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5210  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.46 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.43756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2097  HAD family hydrolase  26.19 
 
 
268 aa  94  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.978592  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2219  HAD family hydrolase  29.76 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6271  HAD family hydrolase  29.6 
 
 
263 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.690052 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0616  HAD family hydrolase  29.34 
 
 
278 aa  92  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1558  HAD family hydrolase  29.6 
 
 
263 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5932  HAD family hydrolase  27.64 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0595  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.49 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4690  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.16 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3500  HAD family hydrolase  26.59 
 
 
267 aa  80.5  2e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.126173 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06400  hypothetical protein  23.62 
 
 
274 aa  75.5  7e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0644  HAD family hydrolase  27.94 
 
 
283 aa  75.5  8e-13  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4067  HAD family hydrolase  25.79 
 
 
301 aa  73.9  3e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2034  phosphoglycolate phosphatase  25.52 
 
 
226 aa  72.8  5e-12  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.376803  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1119  SPP-like hydrolase  32.34 
 
 
227 aa  67.8  2e-10  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.660919  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1633  SPP-like hydrolase  27.62 
 
 
237 aa  66.6  4e-10  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.64059  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1166  SPP-like hydrolase  26.56 
 
 
240 aa  62.4  6e-09  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0884  SPP-like hydrolase  24.45 
 
 
222 aa  60.5  2e-08  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0788  SPP-like hydrolase  26.47 
 
 
228 aa  60.8  2e-08  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00672208 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  20.82 
 
 
265 aa  59.3  5e-08  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  23.63 
 
 
232 aa  58.5  1e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  3.89482e-05  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  24.88 
 
 
226 aa  55.5  8e-07  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  26.82 
 
 
273 aa  54.3  2e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  26.82 
 
 
273 aa  54.3  2e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  26.82 
 
 
273 aa  54.3  2e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  26.82 
 
 
273 aa  54.3  2e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  26.82 
 
 
273 aa  54.3  2e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  26.82 
 
 
280 aa  54.3  2e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  26.82 
 
 
273 aa  53.5  3e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1965  SPP-like hydrolase  25.32 
 
 
230 aa  53.5  3e-06  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0481119  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1223  SPP-like hydrolase  23.77 
 
 
240 aa  53.5  3e-06  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0131794  normal  0.788944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  25.84 
 
 
272 aa  53.1  4e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1070  SPP-like hydrolase  24.38 
 
 
228 aa  52.8  6e-06  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0195406  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  24.88 
 
 
234 aa  52.4  6e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  21.72 
 
 
237 aa  51.6  1e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  27.49 
 
 
267 aa  50.1  3e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2627  alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase  26.34 
 
 
278 aa  50.4  3e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.371782  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  26.52 
 
 
291 aa  50.1  3e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  41.89 
 
 
261 aa  49.7  4e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2337  phosphoglycolate phosphatase  21.74 
 
 
226 aa  48.9  7e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  0.0135027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  25.1 
 
 
273 aa  48.9  8e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  2.95074e-07 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  27.17 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2100  SPP-like hydrolase  23.08 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2130  SPP-like hydrolase  24.07 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  1.13582e-09  hitchhiker  5.79549e-05 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1809  SPP-like hydrolase  26.15 
 
 
225 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.752467  normal  0.527936 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2968  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.85 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  26.82 
 
 
273 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1156  SPP-like hydrolase  26.29 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902632  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  24.32 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  23.4 
 
 
271 aa  46.2  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  25.7 
 
 
267 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  25.18 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  25.18 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  24.32 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0866  SPP-like hydrolase  26.21 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  24.32 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.78 
 
 
272 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  20 
 
 
277 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  27.23 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  20 
 
 
277 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  26.17 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  27.23 
 
 
244 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  23.86 
 
 
267 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  24.9 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  18.66 
 
 
270 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81508  protein involved in plasmid maintenance, respiration and cell proliferation (by homology)  31 
 
 
768 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  29.46 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4476  sucrose phosphatase  24.69 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3464  Cof-like hydrolase  39.51 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  28.28 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  25.67 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
554 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
554 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  22.8 
 
 
270 aa  42.4  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34680  glucosylglycerol-phosphate synthase  28.43 
 
 
750 aa  42.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.966141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0730  SPP-like hydrolase  21.07 
 
 
222 aa  42  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.842566  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>