More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0553 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  100 
 
 
450 aa  879    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.1 
 
 
432 aa  348  9e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  42.49 
 
 
500 aa  336  3.9999999999999995e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  44.94 
 
 
489 aa  330  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.08 
 
 
487 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.08 
 
 
487 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.82 
 
 
490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  39.92 
 
 
517 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.96 
 
 
504 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  35.15 
 
 
357 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  35.41 
 
 
357 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  38.97 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  38.93 
 
 
417 aa  203  4e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  37.63 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  31.18 
 
 
356 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  28.97 
 
 
353 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  28.82 
 
 
353 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  33.45 
 
 
353 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  36.52 
 
 
353 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.42 
 
 
505 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.26 
 
 
500 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  32.44 
 
 
509 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.3 
 
 
448 aa  147  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.39 
 
 
496 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.77 
 
 
496 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  28.23 
 
 
400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.29 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  30.28 
 
 
329 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  30.81 
 
 
417 aa  120  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.34 
 
 
404 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.71 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  29.18 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.68 
 
 
432 aa  116  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  25.3 
 
 
417 aa  116  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  28.57 
 
 
335 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  28.06 
 
 
489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  29.4 
 
 
471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  28.71 
 
 
329 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.48 
 
 
509 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  27.73 
 
 
461 aa  111  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  31.46 
 
 
342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5231  HlyD family secretion protein  30.03 
 
 
426 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  28.37 
 
 
449 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  26.14 
 
 
607 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  29.13 
 
 
510 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  28.48 
 
 
328 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 
462 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  28.48 
 
 
328 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  33.56 
 
 
352 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  23.71 
 
 
417 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  26.33 
 
 
426 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  31.51 
 
 
335 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  27.4 
 
 
411 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  35.41 
 
 
356 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.52 
 
 
428 aa  102  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  29.7 
 
 
354 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.46 
 
 
404 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5197  hypothetical protein  28.46 
 
 
411 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0742487 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  26.77 
 
 
331 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  35.22 
 
 
320 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  25.42 
 
 
421 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.4 
 
 
448 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  30.77 
 
 
333 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  26.98 
 
 
379 aa  98.6  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30.45 
 
 
333 aa  99  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 
414 aa  98.2  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  34.47 
 
 
358 aa  97.8  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0254  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.53 
 
 
417 aa  98.2  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  31.95 
 
 
342 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  33.97 
 
 
390 aa  98.2  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  33.58 
 
 
352 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  27.23 
 
 
402 aa  98.2  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  26.99 
 
 
364 aa  98.2  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  26.21 
 
 
328 aa  97.8  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60760  hypothetical protein  28.74 
 
 
425 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  25.85 
 
 
407 aa  96.7  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.98 
 
 
479 aa  97.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  31.66 
 
 
353 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1596  secretion protein HlyD family protein  29.04 
 
 
420 aa  96.7  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  27.32 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  26.39 
 
 
368 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1504  secretion protein HlyD family protein  24.66 
 
 
403 aa  96.3  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  28.74 
 
 
353 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 
419 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  30.99 
 
 
334 aa  95.5  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  29.38 
 
 
399 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  26.59 
 
 
405 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  30.97 
 
 
344 aa  95.5  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.25 
 
 
335 aa  94.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  28.94 
 
 
345 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  26.42 
 
 
334 aa  94.4  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  25.06 
 
 
424 aa  94  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  28.33 
 
 
384 aa  93.6  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.25 
 
 
465 aa  93.2  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  26.71 
 
 
352 aa  93.2  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  27.3 
 
 
359 aa  93.2  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  32.73 
 
 
353 aa  93.2  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  32.84 
 
 
354 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  25.18 
 
 
408 aa  92.8  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  24.49 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>