More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0536 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  100 
 
 
80 aa  151  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  81.25 
 
 
80 aa  124  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  80 
 
 
103 aa  123  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  80 
 
 
80 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  80.77 
 
 
80 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  80.77 
 
 
80 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  77.5 
 
 
80 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  78.21 
 
 
80 aa  116  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  80.77 
 
 
79 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  77.5 
 
 
79 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  77.5 
 
 
79 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  69.23 
 
 
81 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  70.37 
 
 
84 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  69.33 
 
 
110 aa  98.6  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  62.03 
 
 
81 aa  97.8  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  66.67 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  69.44 
 
 
77 aa  97.1  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  65.79 
 
 
78 aa  97.1  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  70.42 
 
 
81 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  68.06 
 
 
79 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  66.22 
 
 
78 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  71.01 
 
 
78 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  71.01 
 
 
78 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  68.06 
 
 
79 aa  95.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  68.42 
 
 
79 aa  94.4  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  68.49 
 
 
77 aa  94.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  94.4  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  68.49 
 
 
77 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  69.01 
 
 
78 aa  94  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  67.11 
 
 
79 aa  94  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  70.42 
 
 
77 aa  93.6  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  65 
 
 
83 aa  93.6  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  68.06 
 
 
78 aa  93.6  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  69.01 
 
 
77 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  69.01 
 
 
77 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  69.01 
 
 
77 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  61.33 
 
 
77 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  69.01 
 
 
77 aa  92  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  65.75 
 
 
76 aa  92.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  63.16 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  65.28 
 
 
75 aa  92.8  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  55.13 
 
 
83 aa  91.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  67.61 
 
 
77 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  67.61 
 
 
79 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  58.97 
 
 
82 aa  91.3  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  67.61 
 
 
79 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  67.61 
 
 
79 aa  91.3  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  67.61 
 
 
79 aa  90.9  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  67.61 
 
 
79 aa  91.3  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  67.61 
 
 
79 aa  91.3  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  55.13 
 
 
78 aa  90.5  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  58.67 
 
 
81 aa  90.5  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  61.64 
 
 
73 aa  90.1  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  63.01 
 
 
79 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  63.01 
 
 
79 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  63.01 
 
 
79 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  90.1  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  64.86 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  62.5 
 
 
80 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  62.67 
 
 
77 aa  89.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  71.01 
 
 
78 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  58.97 
 
 
80 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  55.13 
 
 
78 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  63.89 
 
 
77 aa  89.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  61.33 
 
 
82 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  61.33 
 
 
82 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  63.01 
 
 
77 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  63.01 
 
 
77 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  65.33 
 
 
78 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  63.01 
 
 
77 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1661  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  89  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  63.51 
 
 
78 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  65.33 
 
 
78 aa  88.6  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  64.86 
 
 
78 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  63.01 
 
 
77 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  63.01 
 
 
77 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  63.01 
 
 
77 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  63.01 
 
 
77 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  63.01 
 
 
77 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  55.13 
 
 
78 aa  88.2  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  64 
 
 
78 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  65.38 
 
 
82 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>