More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0512 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  798    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  53.48 
 
 		 391 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  49.2 
 
 		 392 aa  401  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  50.8 
 
 		 391 aa  378  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  47.1 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  51.12 
 
 		 393 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  51.12 
 
 		 393 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  41.07 
 
 		 395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  40.8 
 
 		 395 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  43.8 
 
 		 374 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  38.38 
 
 		 401 aa  315  8e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  39.48 
 
 		 401 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  38.81 
 
 		 434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  42.37 
 
 		 384 aa  302  6.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  38.02 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  37.67 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  39.31 
 
 		 403 aa  292  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  40.76 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  36 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  36.94 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  36.94 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  35.55 
 
 		 386 aa  211  3e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  31.28 
 
 		 365 aa  202  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  32.22 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  26.42 
 
 		 356 aa  140  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  29.35 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  28.69 
 
 		 418 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  30.79 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  30.71 
 
 		 391 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  28.07 
 
 		 382 aa  123  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  26.81 
 
 		 1040 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  27.66 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  25.91 
 
 		 792 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  28.07 
 
 		 423 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  23.87 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  27.66 
 
 		 360 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  27.37 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 360 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.21 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  24.16 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  23.71 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  28.17 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  34.51 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.32 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  22.83 
 
 		 360 aa  93.6  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  23.78 
 
 		 392 aa  93.2  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.84 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  24.35 
 
 		 363 aa  90.9  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 360 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 		 1096 aa  89.7  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  23.8 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  24.64 
 
 		 380 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  26.03 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  24.47 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  26.3 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  21.66 
 
 		 1061 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  25.66 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  23.39 
 
 		 362 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  21.12 
 
 		 1061 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  24.27 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  24.25 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  21.17 
 
 		 1153 aa  80.9  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  24.08 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  26.91 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  22.1 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  21.29 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  26.79 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  24.42 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  29.38 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  26.26 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  24.54 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  22.54 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  23.38 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  24.28 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 		 367 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  22.38 
 
 		 370 aa  72.8  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  26.79 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  25.53 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  25.31 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.53 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  22.98 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.67 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  24.17 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  22.36 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  23.95 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  23.34 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  25.72 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  24.31 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  24.27 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  22.1 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  21.68 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>